Protein–RNA interactions for Protein: P49221

TGM4, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase 4, humanhuman

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGM4P49221 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TGM4P49221 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TGM4P49221 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TGM4P49221 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TGM4P49221 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TGM4P49221 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TGM4P49221 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TGM4P49221 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TGM4P49221 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TGM4P49221 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TGM4P49221 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TGM4P49221 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TGM4P49221 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TGM4P49221 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TGM4P49221 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TGM4P49221 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TGM4P49221 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TGM4P49221 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TGM4P49221 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TGM4P49221 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TGM4P49221 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TGM4P49221 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TGM4P49221 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TGM4P49221 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TGM4P49221 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TGM4P49221 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TGM4P49221 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TGM4P49221 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TGM4P49221 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TGM4P49221 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TGM4P49221 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TGM4P49221 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TGM4P49221 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TGM4P49221 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TGM4P49221 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TGM4P49221 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TGM4P49221 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TGM4P49221 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TGM4P49221 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TGM4P49221 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TGM4P49221 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TGM4P49221 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TGM4P49221 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TGM4P49221 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TGM4P49221 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TGM4P49221 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TGM4P49221 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TGM4P49221 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TGM4P49221 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TGM4P49221 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TGM4P49221 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TGM4P49221 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TGM4P49221 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TGM4P49221 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TGM4P49221 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TGM4P49221 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TGM4P49221 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TGM4P49221 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TGM4P49221 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TGM4P49221 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TGM4P49221 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TGM4P49221 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TGM4P49221 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TGM4P49221 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TGM4P49221 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TGM4P49221 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TGM4P49221 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TGM4P49221 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TGM4P49221 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TGM4P49221 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TGM4P49221 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TGM4P49221 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TGM4P49221 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TGM4P49221 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TGM4P49221 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TGM4P49221 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TGM4P49221 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TGM4P49221 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TGM4P49221 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TGM4P49221 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TGM4P49221 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TGM4P49221 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TGM4P49221 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TGM4P49221 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TGM4P49221 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TGM4P49221 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TGM4P49221 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TGM4P49221 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TGM4P49221 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TGM4P49221 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TGM4P49221 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TGM4P49221 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TGM4P49221 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TGM4P49221 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TGM4P49221 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TGM4P49221 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TGM4P49221 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TGM4P49221 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TGM4P49221 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TGM4P49221 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms