Protein–RNA interactions for Protein: P36406

TRIM23, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM23, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM23P36406 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRIM23P36406 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRIM23P36406 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRIM23P36406 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRIM23P36406 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRIM23P36406 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRIM23P36406 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRIM23P36406 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
TRIM23P36406 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRIM23P36406 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRIM23P36406 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRIM23P36406 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRIM23P36406 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRIM23P36406 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRIM23P36406 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRIM23P36406 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
TRIM23P36406 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRIM23P36406 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRIM23P36406 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRIM23P36406 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRIM23P36406 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRIM23P36406 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRIM23P36406 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRIM23P36406 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
TRIM23P36406 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRIM23P36406 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRIM23P36406 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRIM23P36406 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRIM23P36406 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRIM23P36406 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRIM23P36406 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
TRIM23P36406 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRIM23P36406 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRIM23P36406 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRIM23P36406 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRIM23P36406 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
TRIM23P36406 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
TRIM23P36406 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRIM23P36406 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRIM23P36406 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRIM23P36406 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
TRIM23P36406 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
TRIM23P36406 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRIM23P36406 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRIM23P36406 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
TRIM23P36406 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRIM23P36406 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRIM23P36406 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRIM23P36406 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRIM23P36406 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRIM23P36406 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRIM23P36406 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRIM23P36406 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRIM23P36406 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRIM23P36406 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRIM23P36406 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRIM23P36406 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRIM23P36406 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRIM23P36406 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRIM23P36406 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRIM23P36406 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
TRIM23P36406 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRIM23P36406 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRIM23P36406 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
TRIM23P36406 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRIM23P36406 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRIM23P36406 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRIM23P36406 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRIM23P36406 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRIM23P36406 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRIM23P36406 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRIM23P36406 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRIM23P36406 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRIM23P36406 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRIM23P36406 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRIM23P36406 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRIM23P36406 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRIM23P36406 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRIM23P36406 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRIM23P36406 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRIM23P36406 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRIM23P36406 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRIM23P36406 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRIM23P36406 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRIM23P36406 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRIM23P36406 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRIM23P36406 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRIM23P36406 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRIM23P36406 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRIM23P36406 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRIM23P36406 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
TRIM23P36406 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRIM23P36406 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRIM23P36406 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRIM23P36406 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRIM23P36406 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRIM23P36406 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRIM23P36406 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
TRIM23P36406 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
TRIM23P36406 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms