Protein–RNA interactions for Protein: P35658

NUP214, Nuclear pore complex protein Nup214, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,090 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP214P35658 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NUP214P35658 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NUP214P35658 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NUP214P35658 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NUP214P35658 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NUP214P35658 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NUP214P35658 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NUP214P35658 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NUP214P35658 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
NUP214P35658 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
NUP214P35658 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC16.39■□□□□ 0.22
NUP214P35658 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
NUP214P35658 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NUP214P35658 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NUP214P35658 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NUP214P35658 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NUP214P35658 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
NUP214P35658 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
NUP214P35658 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NUP214P35658 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NUP214P35658 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
NUP214P35658 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
NUP214P35658 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
NUP214P35658 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NUP214P35658 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NUP214P35658 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NUP214P35658 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NUP214P35658 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NUP214P35658 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NUP214P35658 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NUP214P35658 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NUP214P35658 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NUP214P35658 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NUP214P35658 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NUP214P35658 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NUP214P35658 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NUP214P35658 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NUP214P35658 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NUP214P35658 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NUP214P35658 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NUP214P35658 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NUP214P35658 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NUP214P35658 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NUP214P35658 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NUP214P35658 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NUP214P35658 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NUP214P35658 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NUP214P35658 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NUP214P35658 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NUP214P35658 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NUP214P35658 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NUP214P35658 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NUP214P35658 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NUP214P35658 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NUP214P35658 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NUP214P35658 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NUP214P35658 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NUP214P35658 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NUP214P35658 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NUP214P35658 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NUP214P35658 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NUP214P35658 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NUP214P35658 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NUP214P35658 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NUP214P35658 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
NUP214P35658 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NUP214P35658 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NUP214P35658 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NUP214P35658 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NUP214P35658 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NUP214P35658 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NUP214P35658 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NUP214P35658 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NUP214P35658 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NUP214P35658 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NUP214P35658 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NUP214P35658 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NUP214P35658 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
NUP214P35658 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NUP214P35658 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NUP214P35658 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NUP214P35658 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NUP214P35658 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NUP214P35658 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
NUP214P35658 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
NUP214P35658 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NUP214P35658 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NUP214P35658 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
NUP214P35658 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NUP214P35658 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NUP214P35658 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NUP214P35658 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NUP214P35658 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NUP214P35658 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NUP214P35658 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NUP214P35658 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NUP214P35658 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NUP214P35658 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NUP214P35658 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NUP214P35658 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms