Protein–RNA interactions for Protein: P35222

CTNNB1, Catenin beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNB1P35222 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTNNB1P35222 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTNNB1P35222 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTNNB1P35222 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTNNB1P35222 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTNNB1P35222 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTNNB1P35222 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTNNB1P35222 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTNNB1P35222 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTNNB1P35222 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTNNB1P35222 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTNNB1P35222 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CTNNB1P35222 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CTNNB1P35222 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTNNB1P35222 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTNNB1P35222 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTNNB1P35222 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTNNB1P35222 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTNNB1P35222 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTNNB1P35222 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTNNB1P35222 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTNNB1P35222 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTNNB1P35222 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTNNB1P35222 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTNNB1P35222 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTNNB1P35222 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CTNNB1P35222 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTNNB1P35222 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTNNB1P35222 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTNNB1P35222 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTNNB1P35222 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTNNB1P35222 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTNNB1P35222 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTNNB1P35222 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTNNB1P35222 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTNNB1P35222 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTNNB1P35222 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTNNB1P35222 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTNNB1P35222 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CTNNB1P35222 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTNNB1P35222 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTNNB1P35222 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTNNB1P35222 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CTNNB1P35222 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTNNB1P35222 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTNNB1P35222 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CTNNB1P35222 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTNNB1P35222 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CTNNB1P35222 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CTNNB1P35222 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTNNB1P35222 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTNNB1P35222 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTNNB1P35222 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTNNB1P35222 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTNNB1P35222 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTNNB1P35222 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTNNB1P35222 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CTNNB1P35222 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CTNNB1P35222 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTNNB1P35222 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTNNB1P35222 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTNNB1P35222 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTNNB1P35222 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CTNNB1P35222 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CTNNB1P35222 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CTNNB1P35222 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CTNNB1P35222 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CTNNB1P35222 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CTNNB1P35222 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CTNNB1P35222 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CTNNB1P35222 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CTNNB1P35222 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CTNNB1P35222 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CTNNB1P35222 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CTNNB1P35222 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CTNNB1P35222 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CTNNB1P35222 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CTNNB1P35222 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CTNNB1P35222 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CTNNB1P35222 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CTNNB1P35222 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CTNNB1P35222 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CTNNB1P35222 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CTNNB1P35222 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CTNNB1P35222 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CTNNB1P35222 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CTNNB1P35222 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CTNNB1P35222 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CTNNB1P35222 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CTNNB1P35222 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CTNNB1P35222 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CTNNB1P35222 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CTNNB1P35222 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CTNNB1P35222 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CTNNB1P35222 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CTNNB1P35222 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CTNNB1P35222 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CTNNB1P35222 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CTNNB1P35222 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CTNNB1P35222 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.3 ms