Protein–RNA interactions for Protein: P29374

ARID4A, AT-rich interactive domain-containing protein 4A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,257 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID4AP29374 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ARID4AP29374 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ARID4AP29374 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
ARID4AP29374 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
ARID4AP29374 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
ARID4AP29374 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ARID4AP29374 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ARID4AP29374 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ARID4AP29374 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ARID4AP29374 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ARID4AP29374 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ARID4AP29374 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ARID4AP29374 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ARID4AP29374 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ARID4AP29374 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ARID4AP29374 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ARID4AP29374 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ARID4AP29374 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ARID4AP29374 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ARID4AP29374 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ARID4AP29374 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ARID4AP29374 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
ARID4AP29374 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ARID4AP29374 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ARID4AP29374 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ARID4AP29374 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
ARID4AP29374 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ARID4AP29374 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ARID4AP29374 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ARID4AP29374 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
ARID4AP29374 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
ARID4AP29374 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ARID4AP29374 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ARID4AP29374 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ARID4AP29374 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ARID4AP29374 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ARID4AP29374 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ARID4AP29374 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ARID4AP29374 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ARID4AP29374 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ARID4AP29374 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ARID4AP29374 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ARID4AP29374 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ARID4AP29374 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ARID4AP29374 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ARID4AP29374 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ARID4AP29374 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ARID4AP29374 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ARID4AP29374 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ARID4AP29374 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ARID4AP29374 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ARID4AP29374 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ARID4AP29374 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ARID4AP29374 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ARID4AP29374 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ARID4AP29374 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ARID4AP29374 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ARID4AP29374 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ARID4AP29374 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ARID4AP29374 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ARID4AP29374 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ARID4AP29374 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ARID4AP29374 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ARID4AP29374 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ARID4AP29374 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ARID4AP29374 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ARID4AP29374 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ARID4AP29374 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ARID4AP29374 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ARID4AP29374 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ARID4AP29374 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
ARID4AP29374 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ARID4AP29374 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
ARID4AP29374 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ARID4AP29374 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ARID4AP29374 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ARID4AP29374 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ARID4AP29374 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ARID4AP29374 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ARID4AP29374 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ARID4AP29374 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ARID4AP29374 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ARID4AP29374 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ARID4AP29374 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
ARID4AP29374 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ARID4AP29374 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ARID4AP29374 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ARID4AP29374 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
ARID4AP29374 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ARID4AP29374 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
ARID4AP29374 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ARID4AP29374 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ARID4AP29374 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ARID4AP29374 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ARID4AP29374 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ARID4AP29374 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ARID4AP29374 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ARID4AP29374 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ARID4AP29374 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ARID4AP29374 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
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