Protein–RNA interactions for Protein: P23763

VAMP1, Vesicle-associated membrane protein 1, humanhuman

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Length 118 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP1P23763 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
VAMP1P23763 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
VAMP1P23763 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
VAMP1P23763 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VAMP1P23763 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
VAMP1P23763 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VAMP1P23763 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VAMP1P23763 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VAMP1P23763 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
VAMP1P23763 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
VAMP1P23763 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
VAMP1P23763 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VAMP1P23763 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VAMP1P23763 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VAMP1P23763 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VAMP1P23763 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VAMP1P23763 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VAMP1P23763 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
VAMP1P23763 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VAMP1P23763 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VAMP1P23763 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VAMP1P23763 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VAMP1P23763 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VAMP1P23763 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
VAMP1P23763 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
VAMP1P23763 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
VAMP1P23763 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
VAMP1P23763 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
VAMP1P23763 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
VAMP1P23763 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
VAMP1P23763 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
VAMP1P23763 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
VAMP1P23763 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
VAMP1P23763 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VAMP1P23763 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VAMP1P23763 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
VAMP1P23763 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VAMP1P23763 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
VAMP1P23763 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VAMP1P23763 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VAMP1P23763 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
VAMP1P23763 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VAMP1P23763 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VAMP1P23763 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VAMP1P23763 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
VAMP1P23763 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VAMP1P23763 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
VAMP1P23763 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
VAMP1P23763 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
VAMP1P23763 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VAMP1P23763 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VAMP1P23763 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VAMP1P23763 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VAMP1P23763 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
VAMP1P23763 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
VAMP1P23763 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
VAMP1P23763 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
VAMP1P23763 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
VAMP1P23763 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
VAMP1P23763 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
VAMP1P23763 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
VAMP1P23763 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
VAMP1P23763 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
VAMP1P23763 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
VAMP1P23763 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
VAMP1P23763 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
VAMP1P23763 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
VAMP1P23763 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
VAMP1P23763 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
VAMP1P23763 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
VAMP1P23763 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
VAMP1P23763 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
VAMP1P23763 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
VAMP1P23763 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
VAMP1P23763 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
VAMP1P23763 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
VAMP1P23763 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
VAMP1P23763 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
VAMP1P23763 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
VAMP1P23763 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
VAMP1P23763 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
VAMP1P23763 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
VAMP1P23763 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
VAMP1P23763 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
VAMP1P23763 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
VAMP1P23763 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
VAMP1P23763 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
VAMP1P23763 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
VAMP1P23763 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
VAMP1P23763 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
VAMP1P23763 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
VAMP1P23763 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
VAMP1P23763 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
VAMP1P23763 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
VAMP1P23763 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
VAMP1P23763 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
VAMP1P23763 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
VAMP1P23763 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
VAMP1P23763 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
VAMP1P23763 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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