Protein–RNA interactions for Protein: P23229

ITGA6, Integrin alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA6P23229 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
ITGA6P23229 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ITGA6P23229 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ITGA6P23229 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ITGA6P23229 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ITGA6P23229 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ITGA6P23229 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ITGA6P23229 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
ITGA6P23229 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ITGA6P23229 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ITGA6P23229 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ITGA6P23229 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ITGA6P23229 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ITGA6P23229 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ITGA6P23229 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ITGA6P23229 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ITGA6P23229 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ITGA6P23229 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ITGA6P23229 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ITGA6P23229 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ITGA6P23229 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ITGA6P23229 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ITGA6P23229 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ITGA6P23229 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ITGA6P23229 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ITGA6P23229 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ITGA6P23229 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ITGA6P23229 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ITGA6P23229 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ITGA6P23229 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ITGA6P23229 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ITGA6P23229 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
ITGA6P23229 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ITGA6P23229 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
ITGA6P23229 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ITGA6P23229 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
ITGA6P23229 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ITGA6P23229 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ITGA6P23229 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ITGA6P23229 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ITGA6P23229 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
ITGA6P23229 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ITGA6P23229 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ITGA6P23229 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ITGA6P23229 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ITGA6P23229 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ITGA6P23229 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ITGA6P23229 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
ITGA6P23229 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ITGA6P23229 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ITGA6P23229 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ITGA6P23229 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ITGA6P23229 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ITGA6P23229 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ITGA6P23229 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ITGA6P23229 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ITGA6P23229 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ITGA6P23229 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ITGA6P23229 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ITGA6P23229 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ITGA6P23229 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ITGA6P23229 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ITGA6P23229 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
ITGA6P23229 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ITGA6P23229 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ITGA6P23229 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ITGA6P23229 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ITGA6P23229 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ITGA6P23229 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ITGA6P23229 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ITGA6P23229 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ITGA6P23229 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ITGA6P23229 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ITGA6P23229 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ITGA6P23229 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ITGA6P23229 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ITGA6P23229 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
ITGA6P23229 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ITGA6P23229 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ITGA6P23229 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
ITGA6P23229 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ITGA6P23229 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ITGA6P23229 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
ITGA6P23229 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ITGA6P23229 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ITGA6P23229 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
ITGA6P23229 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ITGA6P23229 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ITGA6P23229 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ITGA6P23229 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ITGA6P23229 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ITGA6P23229 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ITGA6P23229 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ITGA6P23229 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ITGA6P23229 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ITGA6P23229 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ITGA6P23229 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ITGA6P23229 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ITGA6P23229 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ITGA6P23229 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.7 ms