Protein–RNA interactions for Protein: P17538

CTRB1, Chymotrypsinogen B, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTRB1P17538 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTRB1P17538 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTRB1P17538 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTRB1P17538 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTRB1P17538 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTRB1P17538 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTRB1P17538 TACR2-201ENST00000373306 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTRB1P17538 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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CTRB1P17538 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTRB1P17538 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTRB1P17538 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTRB1P17538 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTRB1P17538 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTRB1P17538 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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CTRB1P17538 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTRB1P17538 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTRB1P17538 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTRB1P17538 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTRB1P17538 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTRB1P17538 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTRB1P17538 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTRB1P17538 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTRB1P17538 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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CTRB1P17538 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTRB1P17538 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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CTRB1P17538 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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CTRB1P17538 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTRB1P17538 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTRB1P17538 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTRB1P17538 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTRB1P17538 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTRB1P17538 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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CTRB1P17538 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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CTRB1P17538 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTRB1P17538 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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CTRB1P17538 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CTRB1P17538 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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CTRB1P17538 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CTRB1P17538 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CTRB1P17538 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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CTRB1P17538 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CTRB1P17538 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CTRB1P17538 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CTRB1P17538 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CTRB1P17538 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CTRB1P17538 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CTRB1P17538 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CTRB1P17538 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CTRB1P17538 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CTRB1P17538 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CTRB1P17538 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CTRB1P17538 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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CTRB1P17538 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CTRB1P17538 ITGB2-208ENST00000397857 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CTRB1P17538 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTRB1P17538 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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