Protein–RNA interactions for Protein: P16870

CPE, Carboxypeptidase E, humanhuman

Predictions only

Length 476 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPEP16870 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CPEP16870 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CPEP16870 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CPEP16870 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CPEP16870 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CPEP16870 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CPEP16870 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CPEP16870 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CPEP16870 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CPEP16870 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CPEP16870 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CPEP16870 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CPEP16870 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CPEP16870 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CPEP16870 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CPEP16870 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CPEP16870 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CPEP16870 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CPEP16870 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CPEP16870 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CPEP16870 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CPEP16870 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CPEP16870 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CPEP16870 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CPEP16870 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CPEP16870 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CPEP16870 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CPEP16870 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CPEP16870 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CPEP16870 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CPEP16870 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CPEP16870 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CPEP16870 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CPEP16870 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CPEP16870 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CPEP16870 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CPEP16870 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CPEP16870 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CPEP16870 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CPEP16870 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CPEP16870 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CPEP16870 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CPEP16870 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CPEP16870 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CPEP16870 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CPEP16870 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CPEP16870 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CPEP16870 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CPEP16870 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CPEP16870 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CPEP16870 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CPEP16870 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CPEP16870 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CPEP16870 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CPEP16870 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CPEP16870 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CPEP16870 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CPEP16870 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CPEP16870 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CPEP16870 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CPEP16870 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CPEP16870 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CPEP16870 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CPEP16870 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CPEP16870 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CPEP16870 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CPEP16870 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CPEP16870 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CPEP16870 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CPEP16870 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CPEP16870 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CPEP16870 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CPEP16870 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CPEP16870 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CPEP16870 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CPEP16870 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CPEP16870 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CPEP16870 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CPEP16870 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CPEP16870 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CPEP16870 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CPEP16870 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CPEP16870 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CPEP16870 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CPEP16870 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CPEP16870 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CPEP16870 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CPEP16870 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CPEP16870 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CPEP16870 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CPEP16870 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CPEP16870 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CPEP16870 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CPEP16870 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CPEP16870 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CPEP16870 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CPEP16870 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CPEP16870 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CPEP16870 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CPEP16870 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms