Protein–RNA interactions for Protein: P15498

VAV1, Proto-oncogene vav, humanhuman

Predictions only

Length 845 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAV1P15498 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
VAV1P15498 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VAV1P15498 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VAV1P15498 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VAV1P15498 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VAV1P15498 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VAV1P15498 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VAV1P15498 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VAV1P15498 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VAV1P15498 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VAV1P15498 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VAV1P15498 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
VAV1P15498 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VAV1P15498 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VAV1P15498 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VAV1P15498 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VAV1P15498 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VAV1P15498 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
VAV1P15498 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VAV1P15498 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
VAV1P15498 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VAV1P15498 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VAV1P15498 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VAV1P15498 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VAV1P15498 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VAV1P15498 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VAV1P15498 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VAV1P15498 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VAV1P15498 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VAV1P15498 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VAV1P15498 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VAV1P15498 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VAV1P15498 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VAV1P15498 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VAV1P15498 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VAV1P15498 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VAV1P15498 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VAV1P15498 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VAV1P15498 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
VAV1P15498 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VAV1P15498 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VAV1P15498 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
VAV1P15498 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VAV1P15498 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
VAV1P15498 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VAV1P15498 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
VAV1P15498 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC18■□□□□ 0.47
VAV1P15498 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VAV1P15498 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VAV1P15498 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VAV1P15498 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VAV1P15498 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
VAV1P15498 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VAV1P15498 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
VAV1P15498 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VAV1P15498 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VAV1P15498 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
VAV1P15498 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VAV1P15498 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
VAV1P15498 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VAV1P15498 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC18■□□□□ 0.47
VAV1P15498 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
VAV1P15498 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
VAV1P15498 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
VAV1P15498 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC18■□□□□ 0.47
VAV1P15498 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
VAV1P15498 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
VAV1P15498 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
VAV1P15498 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
VAV1P15498 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
VAV1P15498 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
VAV1P15498 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC18■□□□□ 0.47
VAV1P15498 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
VAV1P15498 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
VAV1P15498 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
VAV1P15498 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
VAV1P15498 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
VAV1P15498 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
VAV1P15498 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
VAV1P15498 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VAV1P15498 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VAV1P15498 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VAV1P15498 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
VAV1P15498 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
VAV1P15498 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
VAV1P15498 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
VAV1P15498 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VAV1P15498 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VAV1P15498 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VAV1P15498 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VAV1P15498 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VAV1P15498 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VAV1P15498 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VAV1P15498 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VAV1P15498 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VAV1P15498 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VAV1P15498 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VAV1P15498 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VAV1P15498 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VAV1P15498 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms