Protein–RNA interactions for Protein: P13688

CEACAM1, Carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 1, humanhuman

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEACAM1P13688 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CEACAM1P13688 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CEACAM1P13688 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CEACAM1P13688 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CEACAM1P13688 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CEACAM1P13688 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CEACAM1P13688 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CEACAM1P13688 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CEACAM1P13688 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CEACAM1P13688 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CEACAM1P13688 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CEACAM1P13688 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CEACAM1P13688 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CEACAM1P13688 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CEACAM1P13688 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CEACAM1P13688 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CEACAM1P13688 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CEACAM1P13688 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CEACAM1P13688 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CEACAM1P13688 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CEACAM1P13688 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CEACAM1P13688 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CEACAM1P13688 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CEACAM1P13688 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CEACAM1P13688 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CEACAM1P13688 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CEACAM1P13688 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CEACAM1P13688 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CEACAM1P13688 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CEACAM1P13688 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CEACAM1P13688 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CEACAM1P13688 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CEACAM1P13688 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CEACAM1P13688 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CEACAM1P13688 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CEACAM1P13688 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CEACAM1P13688 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CEACAM1P13688 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CEACAM1P13688 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CEACAM1P13688 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CEACAM1P13688 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CEACAM1P13688 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CEACAM1P13688 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CEACAM1P13688 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CEACAM1P13688 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CEACAM1P13688 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CEACAM1P13688 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CEACAM1P13688 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CEACAM1P13688 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CEACAM1P13688 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CEACAM1P13688 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CEACAM1P13688 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CEACAM1P13688 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CEACAM1P13688 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CEACAM1P13688 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CEACAM1P13688 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CEACAM1P13688 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CEACAM1P13688 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CEACAM1P13688 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CEACAM1P13688 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CEACAM1P13688 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CEACAM1P13688 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CEACAM1P13688 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CEACAM1P13688 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CEACAM1P13688 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CEACAM1P13688 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CEACAM1P13688 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CEACAM1P13688 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CEACAM1P13688 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CEACAM1P13688 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CEACAM1P13688 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CEACAM1P13688 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CEACAM1P13688 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CEACAM1P13688 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CEACAM1P13688 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CEACAM1P13688 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CEACAM1P13688 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CEACAM1P13688 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CEACAM1P13688 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CEACAM1P13688 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CEACAM1P13688 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CEACAM1P13688 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CEACAM1P13688 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CEACAM1P13688 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CEACAM1P13688 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CEACAM1P13688 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CEACAM1P13688 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CEACAM1P13688 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CEACAM1P13688 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CEACAM1P13688 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CEACAM1P13688 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CEACAM1P13688 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CEACAM1P13688 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CEACAM1P13688 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CEACAM1P13688 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CEACAM1P13688 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CEACAM1P13688 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CEACAM1P13688 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CEACAM1P13688 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CEACAM1P13688 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms