Protein–RNA interactions for Protein: P12036

NEFH, Neurofilament heavy polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 1,026 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFHP12036 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NEFHP12036 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NEFHP12036 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NEFHP12036 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NEFHP12036 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NEFHP12036 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NEFHP12036 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NEFHP12036 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NEFHP12036 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
NEFHP12036 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NEFHP12036 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NEFHP12036 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NEFHP12036 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
NEFHP12036 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NEFHP12036 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NEFHP12036 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NEFHP12036 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NEFHP12036 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NEFHP12036 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NEFHP12036 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NEFHP12036 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NEFHP12036 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NEFHP12036 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NEFHP12036 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NEFHP12036 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NEFHP12036 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NEFHP12036 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NEFHP12036 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NEFHP12036 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NEFHP12036 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NEFHP12036 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NEFHP12036 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NEFHP12036 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NEFHP12036 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NEFHP12036 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NEFHP12036 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NEFHP12036 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NEFHP12036 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NEFHP12036 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NEFHP12036 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NEFHP12036 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NEFHP12036 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NEFHP12036 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NEFHP12036 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
NEFHP12036 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
NEFHP12036 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NEFHP12036 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
NEFHP12036 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NEFHP12036 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NEFHP12036 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
NEFHP12036 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NEFHP12036 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NEFHP12036 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NEFHP12036 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NEFHP12036 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NEFHP12036 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NEFHP12036 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NEFHP12036 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NEFHP12036 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NEFHP12036 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NEFHP12036 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NEFHP12036 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NEFHP12036 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NEFHP12036 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NEFHP12036 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NEFHP12036 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NEFHP12036 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NEFHP12036 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NEFHP12036 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NEFHP12036 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NEFHP12036 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NEFHP12036 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NEFHP12036 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NEFHP12036 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NEFHP12036 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NEFHP12036 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
NEFHP12036 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NEFHP12036 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NEFHP12036 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NEFHP12036 TET2-207ENST00000513237 10166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NEFHP12036 TET2-209ENST00000540549 10166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NEFHP12036 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NEFHP12036 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NEFHP12036 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NEFHP12036 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NEFHP12036 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NEFHP12036 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NEFHP12036 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NEFHP12036 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NEFHP12036 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NEFHP12036 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NEFHP12036 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NEFHP12036 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NEFHP12036 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NEFHP12036 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NEFHP12036 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NEFHP12036 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NEFHP12036 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NEFHP12036 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NEFHP12036 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.3 ms