Protein–RNA interactions for Protein: P10589

NR2F1, COUP transcription factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR2F1P10589 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NR2F1P10589 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NR2F1P10589 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NR2F1P10589 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NR2F1P10589 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NR2F1P10589 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NR2F1P10589 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NR2F1P10589 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NR2F1P10589 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NR2F1P10589 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NR2F1P10589 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NR2F1P10589 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NR2F1P10589 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NR2F1P10589 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NR2F1P10589 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NR2F1P10589 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NR2F1P10589 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NR2F1P10589 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NR2F1P10589 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NR2F1P10589 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NR2F1P10589 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NR2F1P10589 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
NR2F1P10589 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NR2F1P10589 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NR2F1P10589 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NR2F1P10589 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
NR2F1P10589 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NR2F1P10589 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NR2F1P10589 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NR2F1P10589 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NR2F1P10589 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NR2F1P10589 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NR2F1P10589 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
NR2F1P10589 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
NR2F1P10589 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
NR2F1P10589 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
NR2F1P10589 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
NR2F1P10589 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
NR2F1P10589 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
NR2F1P10589 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
NR2F1P10589 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
NR2F1P10589 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
NR2F1P10589 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
NR2F1P10589 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
NR2F1P10589 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
NR2F1P10589 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
NR2F1P10589 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
NR2F1P10589 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
NR2F1P10589 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NR2F1P10589 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NR2F1P10589 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NR2F1P10589 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NR2F1P10589 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NR2F1P10589 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NR2F1P10589 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NR2F1P10589 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
NR2F1P10589 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NR2F1P10589 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NR2F1P10589 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NR2F1P10589 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NR2F1P10589 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NR2F1P10589 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NR2F1P10589 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NR2F1P10589 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NR2F1P10589 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NR2F1P10589 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NR2F1P10589 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NR2F1P10589 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NR2F1P10589 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NR2F1P10589 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
NR2F1P10589 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NR2F1P10589 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NR2F1P10589 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
NR2F1P10589 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NR2F1P10589 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NR2F1P10589 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
NR2F1P10589 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NR2F1P10589 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NR2F1P10589 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NR2F1P10589 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NR2F1P10589 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NR2F1P10589 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NR2F1P10589 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NR2F1P10589 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NR2F1P10589 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NR2F1P10589 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NR2F1P10589 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NR2F1P10589 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NR2F1P10589 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NR2F1P10589 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NR2F1P10589 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NR2F1P10589 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NR2F1P10589 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NR2F1P10589 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NR2F1P10589 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NR2F1P10589 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NR2F1P10589 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NR2F1P10589 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NR2F1P10589 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NR2F1P10589 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms