Protein–RNA interactions for Protein: P04818

TYMS, Thymidylate synthase, humanhuman

Predictions only

Length 313 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TYMSP04818 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TYMSP04818 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TYMSP04818 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TYMSP04818 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TYMSP04818 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TYMSP04818 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TYMSP04818 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TYMSP04818 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
TYMSP04818 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TYMSP04818 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TYMSP04818 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TYMSP04818 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TYMSP04818 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TYMSP04818 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TYMSP04818 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
TYMSP04818 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
TYMSP04818 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TYMSP04818 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TYMSP04818 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
TYMSP04818 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TYMSP04818 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TYMSP04818 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TYMSP04818 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TYMSP04818 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TYMSP04818 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TYMSP04818 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TYMSP04818 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TYMSP04818 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TYMSP04818 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TYMSP04818 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TYMSP04818 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TYMSP04818 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TYMSP04818 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TYMSP04818 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TYMSP04818 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TYMSP04818 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TYMSP04818 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TYMSP04818 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TYMSP04818 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TYMSP04818 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TYMSP04818 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TYMSP04818 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
TYMSP04818 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TYMSP04818 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TYMSP04818 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TYMSP04818 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TYMSP04818 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TYMSP04818 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TYMSP04818 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TYMSP04818 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TYMSP04818 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
TYMSP04818 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
TYMSP04818 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TYMSP04818 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TYMSP04818 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TYMSP04818 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TYMSP04818 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TYMSP04818 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TYMSP04818 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TYMSP04818 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TYMSP04818 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TYMSP04818 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
TYMSP04818 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TYMSP04818 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TYMSP04818 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TYMSP04818 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TYMSP04818 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TYMSP04818 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TYMSP04818 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TYMSP04818 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TYMSP04818 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TYMSP04818 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TYMSP04818 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TYMSP04818 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TYMSP04818 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TYMSP04818 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TYMSP04818 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TYMSP04818 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TYMSP04818 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TYMSP04818 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TYMSP04818 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TYMSP04818 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TYMSP04818 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TYMSP04818 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TYMSP04818 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TYMSP04818 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TYMSP04818 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TYMSP04818 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TYMSP04818 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TYMSP04818 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TYMSP04818 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TYMSP04818 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TYMSP04818 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TYMSP04818 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TYMSP04818 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
TYMSP04818 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
TYMSP04818 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
TYMSP04818 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TYMSP04818 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
TYMSP04818 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.8 ms