Protein–RNA interactions for Protein: O95931

CBX7, Chromobox protein homolog 7, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX7O95931 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CBX7O95931 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CBX7O95931 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CBX7O95931 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CBX7O95931 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CBX7O95931 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CBX7O95931 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CBX7O95931 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CBX7O95931 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CBX7O95931 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CBX7O95931 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CBX7O95931 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CBX7O95931 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CBX7O95931 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CBX7O95931 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CBX7O95931 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CBX7O95931 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CBX7O95931 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CBX7O95931 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CBX7O95931 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CBX7O95931 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CBX7O95931 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CBX7O95931 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CBX7O95931 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CBX7O95931 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CBX7O95931 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CBX7O95931 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CBX7O95931 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CBX7O95931 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CBX7O95931 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CBX7O95931 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CBX7O95931 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CBX7O95931 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CBX7O95931 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CBX7O95931 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CBX7O95931 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CBX7O95931 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CBX7O95931 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CBX7O95931 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CBX7O95931 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CBX7O95931 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CBX7O95931 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CBX7O95931 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CBX7O95931 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CBX7O95931 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CBX7O95931 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CBX7O95931 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CBX7O95931 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CBX7O95931 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CBX7O95931 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CBX7O95931 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CBX7O95931 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CBX7O95931 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CBX7O95931 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CBX7O95931 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CBX7O95931 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CBX7O95931 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CBX7O95931 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CBX7O95931 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CBX7O95931 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CBX7O95931 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CBX7O95931 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CBX7O95931 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CBX7O95931 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CBX7O95931 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CBX7O95931 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CBX7O95931 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CBX7O95931 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CBX7O95931 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CBX7O95931 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CBX7O95931 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CBX7O95931 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CBX7O95931 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CBX7O95931 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CBX7O95931 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CBX7O95931 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CBX7O95931 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CBX7O95931 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CBX7O95931 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CBX7O95931 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CBX7O95931 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CBX7O95931 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CBX7O95931 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CBX7O95931 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CBX7O95931 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CBX7O95931 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CBX7O95931 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CBX7O95931 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CBX7O95931 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CBX7O95931 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CBX7O95931 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CBX7O95931 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CBX7O95931 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CBX7O95931 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CBX7O95931 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CBX7O95931 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CBX7O95931 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CBX7O95931 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CBX7O95931 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CBX7O95931 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms