Protein–RNA interactions for Protein: O95236

APOL3, Apolipoprotein L3, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOL3O95236 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOL3O95236 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOL3O95236 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOL3O95236 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOL3O95236 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOL3O95236 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOL3O95236 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOL3O95236 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOL3O95236 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOL3O95236 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOL3O95236 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOL3O95236 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
APOL3O95236 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOL3O95236 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOL3O95236 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOL3O95236 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOL3O95236 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOL3O95236 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOL3O95236 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOL3O95236 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOL3O95236 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOL3O95236 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOL3O95236 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOL3O95236 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOL3O95236 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOL3O95236 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOL3O95236 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOL3O95236 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOL3O95236 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOL3O95236 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
APOL3O95236 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOL3O95236 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOL3O95236 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOL3O95236 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOL3O95236 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOL3O95236 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOL3O95236 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOL3O95236 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOL3O95236 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOL3O95236 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOL3O95236 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOL3O95236 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOL3O95236 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
APOL3O95236 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOL3O95236 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOL3O95236 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOL3O95236 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOL3O95236 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOL3O95236 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOL3O95236 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOL3O95236 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
APOL3O95236 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOL3O95236 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOL3O95236 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOL3O95236 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOL3O95236 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOL3O95236 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
APOL3O95236 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOL3O95236 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOL3O95236 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOL3O95236 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOL3O95236 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOL3O95236 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
APOL3O95236 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOL3O95236 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOL3O95236 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOL3O95236 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOL3O95236 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOL3O95236 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOL3O95236 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOL3O95236 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOL3O95236 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOL3O95236 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOL3O95236 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOL3O95236 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOL3O95236 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOL3O95236 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOL3O95236 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOL3O95236 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOL3O95236 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOL3O95236 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOL3O95236 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOL3O95236 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOL3O95236 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOL3O95236 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOL3O95236 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOL3O95236 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOL3O95236 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOL3O95236 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOL3O95236 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOL3O95236 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOL3O95236 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOL3O95236 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOL3O95236 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOL3O95236 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOL3O95236 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOL3O95236 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOL3O95236 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOL3O95236 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOL3O95236 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms