Protein–RNA interactions for Protein: O94888

UBXN7, UBX domain-containing protein 7, humanhuman

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Length 489 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN7O94888 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
UBXN7O94888 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
UBXN7O94888 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
UBXN7O94888 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
UBXN7O94888 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
UBXN7O94888 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
UBXN7O94888 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
UBXN7O94888 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
UBXN7O94888 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
UBXN7O94888 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
UBXN7O94888 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
UBXN7O94888 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
UBXN7O94888 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
UBXN7O94888 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
UBXN7O94888 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
UBXN7O94888 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
UBXN7O94888 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
UBXN7O94888 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
UBXN7O94888 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
UBXN7O94888 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
UBXN7O94888 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
UBXN7O94888 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
UBXN7O94888 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
UBXN7O94888 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
UBXN7O94888 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
UBXN7O94888 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
UBXN7O94888 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
UBXN7O94888 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
UBXN7O94888 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
UBXN7O94888 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
UBXN7O94888 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
UBXN7O94888 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
UBXN7O94888 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
UBXN7O94888 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
UBXN7O94888 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
UBXN7O94888 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
UBXN7O94888 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
UBXN7O94888 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
UBXN7O94888 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
UBXN7O94888 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
UBXN7O94888 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
UBXN7O94888 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
UBXN7O94888 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
UBXN7O94888 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
UBXN7O94888 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
UBXN7O94888 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
UBXN7O94888 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
UBXN7O94888 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
UBXN7O94888 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
UBXN7O94888 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
UBXN7O94888 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
UBXN7O94888 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
UBXN7O94888 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
UBXN7O94888 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
UBXN7O94888 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
UBXN7O94888 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
UBXN7O94888 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
UBXN7O94888 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
UBXN7O94888 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
UBXN7O94888 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
UBXN7O94888 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
UBXN7O94888 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
UBXN7O94888 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
UBXN7O94888 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
UBXN7O94888 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
UBXN7O94888 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
UBXN7O94888 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
UBXN7O94888 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
UBXN7O94888 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
UBXN7O94888 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
UBXN7O94888 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
UBXN7O94888 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
UBXN7O94888 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
UBXN7O94888 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
UBXN7O94888 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
UBXN7O94888 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
UBXN7O94888 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
UBXN7O94888 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
UBXN7O94888 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
UBXN7O94888 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
UBXN7O94888 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
UBXN7O94888 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
UBXN7O94888 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
UBXN7O94888 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
UBXN7O94888 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
UBXN7O94888 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
UBXN7O94888 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
UBXN7O94888 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
UBXN7O94888 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
UBXN7O94888 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
UBXN7O94888 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
UBXN7O94888 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
UBXN7O94888 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
UBXN7O94888 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
UBXN7O94888 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
UBXN7O94888 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
UBXN7O94888 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
UBXN7O94888 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
UBXN7O94888 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
UBXN7O94888 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
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