Protein–RNA interactions for Protein: O43918

AIRE, Autoimmune regulator, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AIREO43918 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AIREO43918 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AIREO43918 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AIREO43918 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
AIREO43918 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AIREO43918 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
AIREO43918 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
AIREO43918 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
AIREO43918 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AIREO43918 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AIREO43918 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AIREO43918 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AIREO43918 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AIREO43918 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AIREO43918 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AIREO43918 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AIREO43918 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AIREO43918 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AIREO43918 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
AIREO43918 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
AIREO43918 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AIREO43918 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AIREO43918 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AIREO43918 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AIREO43918 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AIREO43918 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AIREO43918 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AIREO43918 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AIREO43918 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AIREO43918 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AIREO43918 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AIREO43918 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AIREO43918 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AIREO43918 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AIREO43918 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AIREO43918 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AIREO43918 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AIREO43918 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AIREO43918 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AIREO43918 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AIREO43918 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
AIREO43918 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AIREO43918 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AIREO43918 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AIREO43918 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AIREO43918 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AIREO43918 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
AIREO43918 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AIREO43918 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AIREO43918 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AIREO43918 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AIREO43918 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AIREO43918 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AIREO43918 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AIREO43918 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AIREO43918 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AIREO43918 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AIREO43918 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AIREO43918 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AIREO43918 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AIREO43918 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AIREO43918 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AIREO43918 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AIREO43918 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AIREO43918 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AIREO43918 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AIREO43918 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
AIREO43918 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
AIREO43918 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
AIREO43918 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
AIREO43918 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
AIREO43918 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
AIREO43918 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
AIREO43918 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AIREO43918 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AIREO43918 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AIREO43918 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
AIREO43918 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
AIREO43918 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
AIREO43918 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AIREO43918 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AIREO43918 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
AIREO43918 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
AIREO43918 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
AIREO43918 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AIREO43918 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
AIREO43918 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AIREO43918 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
AIREO43918 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
AIREO43918 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
AIREO43918 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
AIREO43918 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AIREO43918 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
AIREO43918 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
AIREO43918 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AIREO43918 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AIREO43918 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
AIREO43918 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AIREO43918 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AIREO43918 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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