Protein–RNA interactions for Protein: O43405

COCH, Cochlin, humanhuman

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COCHO43405 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
COCHO43405 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
COCHO43405 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
COCHO43405 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
COCHO43405 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
COCHO43405 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
COCHO43405 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
COCHO43405 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
COCHO43405 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
COCHO43405 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
COCHO43405 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
COCHO43405 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
COCHO43405 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
COCHO43405 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
COCHO43405 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
COCHO43405 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
COCHO43405 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
COCHO43405 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
COCHO43405 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
COCHO43405 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
COCHO43405 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
COCHO43405 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
COCHO43405 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
COCHO43405 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
COCHO43405 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
COCHO43405 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
COCHO43405 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
COCHO43405 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
COCHO43405 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
COCHO43405 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
COCHO43405 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
COCHO43405 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
COCHO43405 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
COCHO43405 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
COCHO43405 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
COCHO43405 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
COCHO43405 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
COCHO43405 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
COCHO43405 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
COCHO43405 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
COCHO43405 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
COCHO43405 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
COCHO43405 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
COCHO43405 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
COCHO43405 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
COCHO43405 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
COCHO43405 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
COCHO43405 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
COCHO43405 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
COCHO43405 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
COCHO43405 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
COCHO43405 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
COCHO43405 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
COCHO43405 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
COCHO43405 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
COCHO43405 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
COCHO43405 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
COCHO43405 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
COCHO43405 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
COCHO43405 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
COCHO43405 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
COCHO43405 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
COCHO43405 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
COCHO43405 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
COCHO43405 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
COCHO43405 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
COCHO43405 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
COCHO43405 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
COCHO43405 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
COCHO43405 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
COCHO43405 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
COCHO43405 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
COCHO43405 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
COCHO43405 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
COCHO43405 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
COCHO43405 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
COCHO43405 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
COCHO43405 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
COCHO43405 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
COCHO43405 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
COCHO43405 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
COCHO43405 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
COCHO43405 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
COCHO43405 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
COCHO43405 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
COCHO43405 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
COCHO43405 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
COCHO43405 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
COCHO43405 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
COCHO43405 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
COCHO43405 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
COCHO43405 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
COCHO43405 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
COCHO43405 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
COCHO43405 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
COCHO43405 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
COCHO43405 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
COCHO43405 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
COCHO43405 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
COCHO43405 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms