Protein–RNA interactions for Protein: O43364

HOXA2, Homeobox protein Hox-A2, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA2O43364 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXA2O43364 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXA2O43364 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXA2O43364 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXA2O43364 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXA2O43364 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXA2O43364 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXA2O43364 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXA2O43364 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXA2O43364 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXA2O43364 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXA2O43364 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXA2O43364 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXA2O43364 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXA2O43364 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXA2O43364 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXA2O43364 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXA2O43364 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXA2O43364 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXA2O43364 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXA2O43364 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXA2O43364 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXA2O43364 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXA2O43364 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXA2O43364 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXA2O43364 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXA2O43364 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXA2O43364 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXA2O43364 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXA2O43364 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXA2O43364 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXA2O43364 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXA2O43364 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXA2O43364 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXA2O43364 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXA2O43364 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
HOXA2O43364 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXA2O43364 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXA2O43364 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXA2O43364 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXA2O43364 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXA2O43364 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXA2O43364 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXA2O43364 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXA2O43364 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXA2O43364 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXA2O43364 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXA2O43364 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXA2O43364 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXA2O43364 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXA2O43364 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXA2O43364 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXA2O43364 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXA2O43364 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXA2O43364 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXA2O43364 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXA2O43364 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXA2O43364 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXA2O43364 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXA2O43364 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXA2O43364 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXA2O43364 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXA2O43364 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXA2O43364 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXA2O43364 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXA2O43364 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXA2O43364 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXA2O43364 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXA2O43364 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXA2O43364 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXA2O43364 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXA2O43364 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXA2O43364 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXA2O43364 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXA2O43364 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXA2O43364 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXA2O43364 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXA2O43364 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXA2O43364 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXA2O43364 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXA2O43364 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXA2O43364 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXA2O43364 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXA2O43364 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXA2O43364 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXA2O43364 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXA2O43364 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXA2O43364 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXA2O43364 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXA2O43364 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXA2O43364 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXA2O43364 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXA2O43364 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXA2O43364 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXA2O43364 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXA2O43364 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXA2O43364 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXA2O43364 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXA2O43364 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXA2O43364 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms