Protein–RNA interactions for Protein: O15047

SETD1A, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD1AO15047 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SETD1AO15047 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SETD1AO15047 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SETD1AO15047 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SETD1AO15047 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SETD1AO15047 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SETD1AO15047 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SETD1AO15047 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SETD1AO15047 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SETD1AO15047 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SETD1AO15047 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SETD1AO15047 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SETD1AO15047 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SETD1AO15047 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SETD1AO15047 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SETD1AO15047 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SETD1AO15047 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SETD1AO15047 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SETD1AO15047 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SETD1AO15047 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SETD1AO15047 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SETD1AO15047 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SETD1AO15047 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SETD1AO15047 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SETD1AO15047 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SETD1AO15047 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SETD1AO15047 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SETD1AO15047 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SETD1AO15047 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SETD1AO15047 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SETD1AO15047 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SETD1AO15047 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SETD1AO15047 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SETD1AO15047 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SETD1AO15047 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SETD1AO15047 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SETD1AO15047 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SETD1AO15047 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SETD1AO15047 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SETD1AO15047 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SETD1AO15047 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SETD1AO15047 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SETD1AO15047 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SETD1AO15047 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SETD1AO15047 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SETD1AO15047 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SETD1AO15047 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SETD1AO15047 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SETD1AO15047 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SETD1AO15047 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SETD1AO15047 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SETD1AO15047 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SETD1AO15047 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SETD1AO15047 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SETD1AO15047 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SETD1AO15047 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SETD1AO15047 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SETD1AO15047 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SETD1AO15047 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SETD1AO15047 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SETD1AO15047 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SETD1AO15047 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SETD1AO15047 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SETD1AO15047 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SETD1AO15047 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
SETD1AO15047 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SETD1AO15047 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SETD1AO15047 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SETD1AO15047 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
SETD1AO15047 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SETD1AO15047 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SETD1AO15047 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SETD1AO15047 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SETD1AO15047 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SETD1AO15047 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SETD1AO15047 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SETD1AO15047 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SETD1AO15047 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SETD1AO15047 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SETD1AO15047 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SETD1AO15047 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SETD1AO15047 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SETD1AO15047 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SETD1AO15047 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SETD1AO15047 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SETD1AO15047 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SETD1AO15047 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SETD1AO15047 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SETD1AO15047 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SETD1AO15047 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SETD1AO15047 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SETD1AO15047 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SETD1AO15047 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SETD1AO15047 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SETD1AO15047 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SETD1AO15047 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SETD1AO15047 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SETD1AO15047 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SETD1AO15047 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SETD1AO15047 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms