Protein–RNA interactions for Protein: E9PBE3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PBE3 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
E9PBE3 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
E9PBE3 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
E9PBE3 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
E9PBE3 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
E9PBE3 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
E9PBE3 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
E9PBE3 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
E9PBE3 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
E9PBE3 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
E9PBE3 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
E9PBE3 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
E9PBE3 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
E9PBE3 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
E9PBE3 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
E9PBE3 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
E9PBE3 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
E9PBE3 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
E9PBE3 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
E9PBE3 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
E9PBE3 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
E9PBE3 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
E9PBE3 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
E9PBE3 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
E9PBE3 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
E9PBE3 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
E9PBE3 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
E9PBE3 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
E9PBE3 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
E9PBE3 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
E9PBE3 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
E9PBE3 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
E9PBE3 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
E9PBE3 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
E9PBE3 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
E9PBE3 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
E9PBE3 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
E9PBE3 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
E9PBE3 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
E9PBE3 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
E9PBE3 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
E9PBE3 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
E9PBE3 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
E9PBE3 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
E9PBE3 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
E9PBE3 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
E9PBE3 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
E9PBE3 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
E9PBE3 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
E9PBE3 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
E9PBE3 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
E9PBE3 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
E9PBE3 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
E9PBE3 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
E9PBE3 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
E9PBE3 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
E9PBE3 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
E9PBE3 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
E9PBE3 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
E9PBE3 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
E9PBE3 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
E9PBE3 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
E9PBE3 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
E9PBE3 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
E9PBE3 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
E9PBE3 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
E9PBE3 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
E9PBE3 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
E9PBE3 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
E9PBE3 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
E9PBE3 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
E9PBE3 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
E9PBE3 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
E9PBE3 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
E9PBE3 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
E9PBE3 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
E9PBE3 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
E9PBE3 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
E9PBE3 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
E9PBE3 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
E9PBE3 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
E9PBE3 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
E9PBE3 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
E9PBE3 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
E9PBE3 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
E9PBE3 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
E9PBE3 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
E9PBE3 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
E9PBE3 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
E9PBE3 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
E9PBE3 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
E9PBE3 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
E9PBE3 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
E9PBE3 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
E9PBE3 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
E9PBE3 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
E9PBE3 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
E9PBE3 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
E9PBE3 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
E9PBE3 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88 ms