Protein–RNA interactions for Protein: C9JE40

PATL2, Protein PAT1 homolog 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PATL2C9JE40 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PATL2C9JE40 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PATL2C9JE40 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PATL2C9JE40 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PATL2C9JE40 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PATL2C9JE40 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PATL2C9JE40 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PATL2C9JE40 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PATL2C9JE40 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PATL2C9JE40 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PATL2C9JE40 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PATL2C9JE40 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
PATL2C9JE40 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PATL2C9JE40 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PATL2C9JE40 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PATL2C9JE40 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PATL2C9JE40 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
PATL2C9JE40 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PATL2C9JE40 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PATL2C9JE40 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PATL2C9JE40 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PATL2C9JE40 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PATL2C9JE40 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PATL2C9JE40 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PATL2C9JE40 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PATL2C9JE40 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PATL2C9JE40 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PATL2C9JE40 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PATL2C9JE40 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PATL2C9JE40 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PATL2C9JE40 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PATL2C9JE40 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PATL2C9JE40 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PATL2C9JE40 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PATL2C9JE40 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PATL2C9JE40 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PATL2C9JE40 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PATL2C9JE40 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PATL2C9JE40 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PATL2C9JE40 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PATL2C9JE40 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PATL2C9JE40 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PATL2C9JE40 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PATL2C9JE40 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
PATL2C9JE40 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PATL2C9JE40 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
PATL2C9JE40 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PATL2C9JE40 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
PATL2C9JE40 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PATL2C9JE40 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PATL2C9JE40 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PATL2C9JE40 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PATL2C9JE40 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PATL2C9JE40 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PATL2C9JE40 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PATL2C9JE40 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PATL2C9JE40 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PATL2C9JE40 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PATL2C9JE40 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PATL2C9JE40 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PATL2C9JE40 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PATL2C9JE40 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
PATL2C9JE40 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PATL2C9JE40 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
PATL2C9JE40 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PATL2C9JE40 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PATL2C9JE40 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PATL2C9JE40 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
PATL2C9JE40 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PATL2C9JE40 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PATL2C9JE40 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PATL2C9JE40 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PATL2C9JE40 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PATL2C9JE40 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PATL2C9JE40 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PATL2C9JE40 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PATL2C9JE40 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PATL2C9JE40 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
PATL2C9JE40 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PATL2C9JE40 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.91
PATL2C9JE40 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
PATL2C9JE40 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
PATL2C9JE40 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.91
PATL2C9JE40 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
PATL2C9JE40 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PATL2C9JE40 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PATL2C9JE40 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PATL2C9JE40 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PATL2C9JE40 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PATL2C9JE40 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PATL2C9JE40 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PATL2C9JE40 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PATL2C9JE40 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PATL2C9JE40 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PATL2C9JE40 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PATL2C9JE40 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PATL2C9JE40 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PATL2C9JE40 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PATL2C9JE40 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PATL2C9JE40 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms