Protein–RNA interactions for Protein: C9J069

C9orf172, Uncharacterized protein C9orf172, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf172C9J069 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C9orf172C9J069 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C9orf172C9J069 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C9orf172C9J069 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C9orf172C9J069 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C9orf172C9J069 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C9orf172C9J069 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
C9orf172C9J069 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
C9orf172C9J069 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
C9orf172C9J069 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C9orf172C9J069 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C9orf172C9J069 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C9orf172C9J069 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C9orf172C9J069 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C9orf172C9J069 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C9orf172C9J069 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C9orf172C9J069 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C9orf172C9J069 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C9orf172C9J069 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
C9orf172C9J069 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C9orf172C9J069 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C9orf172C9J069 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C9orf172C9J069 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C9orf172C9J069 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
C9orf172C9J069 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
C9orf172C9J069 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C9orf172C9J069 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C9orf172C9J069 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C9orf172C9J069 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C9orf172C9J069 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C9orf172C9J069 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
C9orf172C9J069 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
C9orf172C9J069 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C9orf172C9J069 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C9orf172C9J069 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C9orf172C9J069 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C9orf172C9J069 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C9orf172C9J069 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C9orf172C9J069 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C9orf172C9J069 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
C9orf172C9J069 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C9orf172C9J069 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C9orf172C9J069 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C9orf172C9J069 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C9orf172C9J069 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C9orf172C9J069 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C9orf172C9J069 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C9orf172C9J069 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C9orf172C9J069 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C9orf172C9J069 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C9orf172C9J069 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C9orf172C9J069 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C9orf172C9J069 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C9orf172C9J069 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C9orf172C9J069 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C9orf172C9J069 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C9orf172C9J069 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C9orf172C9J069 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C9orf172C9J069 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C9orf172C9J069 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
C9orf172C9J069 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C9orf172C9J069 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C9orf172C9J069 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C9orf172C9J069 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C9orf172C9J069 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C9orf172C9J069 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C9orf172C9J069 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
C9orf172C9J069 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C9orf172C9J069 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
C9orf172C9J069 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C9orf172C9J069 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C9orf172C9J069 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
C9orf172C9J069 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C9orf172C9J069 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C9orf172C9J069 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C9orf172C9J069 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C9orf172C9J069 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C9orf172C9J069 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C9orf172C9J069 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C9orf172C9J069 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C9orf172C9J069 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C9orf172C9J069 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C9orf172C9J069 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C9orf172C9J069 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C9orf172C9J069 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C9orf172C9J069 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C9orf172C9J069 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C9orf172C9J069 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C9orf172C9J069 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C9orf172C9J069 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C9orf172C9J069 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C9orf172C9J069 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C9orf172C9J069 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C9orf172C9J069 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C9orf172C9J069 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C9orf172C9J069 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C9orf172C9J069 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C9orf172C9J069 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C9orf172C9J069 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
C9orf172C9J069 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms