Protein–RNA interactions for Protein: A6NKF2

ARID3C, AT-rich interactive domain-containing protein 3C, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3CA6NKF2 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ARID3CA6NKF2 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
ARID3CA6NKF2 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
ARID3CA6NKF2 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
ARID3CA6NKF2 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
ARID3CA6NKF2 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC26.89■■□□□ 1.9
ARID3CA6NKF2 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
ARID3CA6NKF2 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
ARID3CA6NKF2 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ARID3CA6NKF2 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ARID3CA6NKF2 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
ARID3CA6NKF2 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
ARID3CA6NKF2 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
ARID3CA6NKF2 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ARID3CA6NKF2 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ARID3CA6NKF2 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ARID3CA6NKF2 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ARID3CA6NKF2 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ARID3CA6NKF2 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ARID3CA6NKF2 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ARID3CA6NKF2 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ARID3CA6NKF2 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ARID3CA6NKF2 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ARID3CA6NKF2 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
ARID3CA6NKF2 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
ARID3CA6NKF2 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ARID3CA6NKF2 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ARID3CA6NKF2 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ARID3CA6NKF2 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ARID3CA6NKF2 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
ARID3CA6NKF2 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ARID3CA6NKF2 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
ARID3CA6NKF2 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ARID3CA6NKF2 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ARID3CA6NKF2 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ARID3CA6NKF2 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ARID3CA6NKF2 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ARID3CA6NKF2 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ARID3CA6NKF2 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ARID3CA6NKF2 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ARID3CA6NKF2 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ARID3CA6NKF2 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
ARID3CA6NKF2 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ARID3CA6NKF2 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ARID3CA6NKF2 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ARID3CA6NKF2 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ARID3CA6NKF2 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ARID3CA6NKF2 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ARID3CA6NKF2 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ARID3CA6NKF2 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ARID3CA6NKF2 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ARID3CA6NKF2 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ARID3CA6NKF2 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ARID3CA6NKF2 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ARID3CA6NKF2 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ARID3CA6NKF2 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ARID3CA6NKF2 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ARID3CA6NKF2 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ARID3CA6NKF2 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
ARID3CA6NKF2 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ARID3CA6NKF2 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ARID3CA6NKF2 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ARID3CA6NKF2 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ARID3CA6NKF2 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ARID3CA6NKF2 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ARID3CA6NKF2 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ARID3CA6NKF2 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ARID3CA6NKF2 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ARID3CA6NKF2 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ARID3CA6NKF2 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ARID3CA6NKF2 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ARID3CA6NKF2 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
ARID3CA6NKF2 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ARID3CA6NKF2 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ARID3CA6NKF2 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ARID3CA6NKF2 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ARID3CA6NKF2 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ARID3CA6NKF2 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ARID3CA6NKF2 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ARID3CA6NKF2 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ARID3CA6NKF2 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ARID3CA6NKF2 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
ARID3CA6NKF2 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ARID3CA6NKF2 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ARID3CA6NKF2 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ARID3CA6NKF2 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ARID3CA6NKF2 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ARID3CA6NKF2 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ARID3CA6NKF2 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ARID3CA6NKF2 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ARID3CA6NKF2 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ARID3CA6NKF2 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ARID3CA6NKF2 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ARID3CA6NKF2 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ARID3CA6NKF2 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ARID3CA6NKF2 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ARID3CA6NKF2 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ARID3CA6NKF2 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ARID3CA6NKF2 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ARID3CA6NKF2 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms