Protein–RNA interactions for Protein: A6NDN3

GOLGA6B, Golgin subfamily A member 6B, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6BA6NDN3 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GOLGA6BA6NDN3 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GOLGA6BA6NDN3 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GOLGA6BA6NDN3 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GOLGA6BA6NDN3 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GOLGA6BA6NDN3 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GOLGA6BA6NDN3 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GOLGA6BA6NDN3 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GOLGA6BA6NDN3 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GOLGA6BA6NDN3 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GOLGA6BA6NDN3 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GOLGA6BA6NDN3 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GOLGA6BA6NDN3 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GOLGA6BA6NDN3 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GOLGA6BA6NDN3 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GOLGA6BA6NDN3 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GOLGA6BA6NDN3 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
GOLGA6BA6NDN3 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GOLGA6BA6NDN3 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GOLGA6BA6NDN3 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GOLGA6BA6NDN3 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GOLGA6BA6NDN3 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GOLGA6BA6NDN3 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GOLGA6BA6NDN3 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GOLGA6BA6NDN3 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GOLGA6BA6NDN3 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GOLGA6BA6NDN3 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GOLGA6BA6NDN3 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GOLGA6BA6NDN3 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GOLGA6BA6NDN3 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GOLGA6BA6NDN3 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GOLGA6BA6NDN3 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GOLGA6BA6NDN3 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GOLGA6BA6NDN3 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GOLGA6BA6NDN3 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GOLGA6BA6NDN3 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GOLGA6BA6NDN3 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GOLGA6BA6NDN3 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GOLGA6BA6NDN3 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
GOLGA6BA6NDN3 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GOLGA6BA6NDN3 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GOLGA6BA6NDN3 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GOLGA6BA6NDN3 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GOLGA6BA6NDN3 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
GOLGA6BA6NDN3 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GOLGA6BA6NDN3 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GOLGA6BA6NDN3 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GOLGA6BA6NDN3 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GOLGA6BA6NDN3 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GOLGA6BA6NDN3 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GOLGA6BA6NDN3 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GOLGA6BA6NDN3 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GOLGA6BA6NDN3 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GOLGA6BA6NDN3 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GOLGA6BA6NDN3 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GOLGA6BA6NDN3 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GOLGA6BA6NDN3 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GOLGA6BA6NDN3 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
GOLGA6BA6NDN3 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GOLGA6BA6NDN3 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GOLGA6BA6NDN3 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GOLGA6BA6NDN3 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GOLGA6BA6NDN3 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
GOLGA6BA6NDN3 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GOLGA6BA6NDN3 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GOLGA6BA6NDN3 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GOLGA6BA6NDN3 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GOLGA6BA6NDN3 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GOLGA6BA6NDN3 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GOLGA6BA6NDN3 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GOLGA6BA6NDN3 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GOLGA6BA6NDN3 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GOLGA6BA6NDN3 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GOLGA6BA6NDN3 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GOLGA6BA6NDN3 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GOLGA6BA6NDN3 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GOLGA6BA6NDN3 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GOLGA6BA6NDN3 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GOLGA6BA6NDN3 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GOLGA6BA6NDN3 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GOLGA6BA6NDN3 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GOLGA6BA6NDN3 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GOLGA6BA6NDN3 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GOLGA6BA6NDN3 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GOLGA6BA6NDN3 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GOLGA6BA6NDN3 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GOLGA6BA6NDN3 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GOLGA6BA6NDN3 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GOLGA6BA6NDN3 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GOLGA6BA6NDN3 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
GOLGA6BA6NDN3 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GOLGA6BA6NDN3 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GOLGA6BA6NDN3 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GOLGA6BA6NDN3 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GOLGA6BA6NDN3 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GOLGA6BA6NDN3 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GOLGA6BA6NDN3 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GOLGA6BA6NDN3 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GOLGA6BA6NDN3 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GOLGA6BA6NDN3 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms