Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W8

SNX13, Sorting nexin-13, humanhuman

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Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX13Q9Y5W8 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SNX13Q9Y5W8 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SNX13Q9Y5W8 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SNX13Q9Y5W8 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SNX13Q9Y5W8 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SNX13Q9Y5W8 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SNX13Q9Y5W8 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SNX13Q9Y5W8 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SNX13Q9Y5W8 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SNX13Q9Y5W8 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SNX13Q9Y5W8 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SNX13Q9Y5W8 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SNX13Q9Y5W8 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SNX13Q9Y5W8 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SNX13Q9Y5W8 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SNX13Q9Y5W8 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SNX13Q9Y5W8 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SNX13Q9Y5W8 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SNX13Q9Y5W8 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SNX13Q9Y5W8 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SNX13Q9Y5W8 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SNX13Q9Y5W8 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SNX13Q9Y5W8 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SNX13Q9Y5W8 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SNX13Q9Y5W8 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNX13Q9Y5W8 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNX13Q9Y5W8 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNX13Q9Y5W8 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNX13Q9Y5W8 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNX13Q9Y5W8 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNX13Q9Y5W8 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNX13Q9Y5W8 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNX13Q9Y5W8 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNX13Q9Y5W8 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNX13Q9Y5W8 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNX13Q9Y5W8 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNX13Q9Y5W8 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNX13Q9Y5W8 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNX13Q9Y5W8 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNX13Q9Y5W8 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNX13Q9Y5W8 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNX13Q9Y5W8 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNX13Q9Y5W8 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
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SNX13Q9Y5W8 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNX13Q9Y5W8 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
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SNX13Q9Y5W8 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNX13Q9Y5W8 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNX13Q9Y5W8 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNX13Q9Y5W8 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNX13Q9Y5W8 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNX13Q9Y5W8 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
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SNX13Q9Y5W8 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNX13Q9Y5W8 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNX13Q9Y5W8 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNX13Q9Y5W8 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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SNX13Q9Y5W8 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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SNX13Q9Y5W8 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNX13Q9Y5W8 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNX13Q9Y5W8 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNX13Q9Y5W8 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SNX13Q9Y5W8 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNX13Q9Y5W8 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNX13Q9Y5W8 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNX13Q9Y5W8 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNX13Q9Y5W8 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNX13Q9Y5W8 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNX13Q9Y5W8 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNX13Q9Y5W8 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNX13Q9Y5W8 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNX13Q9Y5W8 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNX13Q9Y5W8 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNX13Q9Y5W8 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNX13Q9Y5W8 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNX13Q9Y5W8 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNX13Q9Y5W8 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNX13Q9Y5W8 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNX13Q9Y5W8 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
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