Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4E8

USP15, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 15, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 981 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP15Q9Y4E8 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
USP15Q9Y4E8 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
USP15Q9Y4E8 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
USP15Q9Y4E8 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
USP15Q9Y4E8 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
USP15Q9Y4E8 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
USP15Q9Y4E8 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
USP15Q9Y4E8 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
USP15Q9Y4E8 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
USP15Q9Y4E8 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
USP15Q9Y4E8 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
USP15Q9Y4E8 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
USP15Q9Y4E8 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
USP15Q9Y4E8 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
USP15Q9Y4E8 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
USP15Q9Y4E8 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
USP15Q9Y4E8 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
USP15Q9Y4E8 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
USP15Q9Y4E8 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
USP15Q9Y4E8 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
USP15Q9Y4E8 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP15Q9Y4E8 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP15Q9Y4E8 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP15Q9Y4E8 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP15Q9Y4E8 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP15Q9Y4E8 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP15Q9Y4E8 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP15Q9Y4E8 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP15Q9Y4E8 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP15Q9Y4E8 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP15Q9Y4E8 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP15Q9Y4E8 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP15Q9Y4E8 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP15Q9Y4E8 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP15Q9Y4E8 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP15Q9Y4E8 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP15Q9Y4E8 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP15Q9Y4E8 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
USP15Q9Y4E8 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
USP15Q9Y4E8 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP15Q9Y4E8 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP15Q9Y4E8 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP15Q9Y4E8 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP15Q9Y4E8 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
USP15Q9Y4E8 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
USP15Q9Y4E8 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
USP15Q9Y4E8 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP15Q9Y4E8 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP15Q9Y4E8 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP15Q9Y4E8 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP15Q9Y4E8 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP15Q9Y4E8 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
USP15Q9Y4E8 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
USP15Q9Y4E8 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
USP15Q9Y4E8 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
USP15Q9Y4E8 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
USP15Q9Y4E8 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
USP15Q9Y4E8 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
USP15Q9Y4E8 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
USP15Q9Y4E8 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
USP15Q9Y4E8 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
USP15Q9Y4E8 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
USP15Q9Y4E8 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
USP15Q9Y4E8 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
USP15Q9Y4E8 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
USP15Q9Y4E8 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
USP15Q9Y4E8 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
USP15Q9Y4E8 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
USP15Q9Y4E8 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
USP15Q9Y4E8 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
USP15Q9Y4E8 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
USP15Q9Y4E8 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
USP15Q9Y4E8 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
USP15Q9Y4E8 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
USP15Q9Y4E8 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
USP15Q9Y4E8 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
USP15Q9Y4E8 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
USP15Q9Y4E8 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
USP15Q9Y4E8 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
USP15Q9Y4E8 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
USP15Q9Y4E8 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
USP15Q9Y4E8 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
USP15Q9Y4E8 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
USP15Q9Y4E8 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
USP15Q9Y4E8 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
USP15Q9Y4E8 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
USP15Q9Y4E8 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
USP15Q9Y4E8 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
USP15Q9Y4E8 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
USP15Q9Y4E8 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
USP15Q9Y4E8 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
USP15Q9Y4E8 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
USP15Q9Y4E8 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
USP15Q9Y4E8 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
USP15Q9Y4E8 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
USP15Q9Y4E8 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
USP15Q9Y4E8 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
USP15Q9Y4E8 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
USP15Q9Y4E8 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
USP15Q9Y4E8 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
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