Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2K7

KDM2A, Lysine-specific demethylase 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM2AQ9Y2K7 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
KDM2AQ9Y2K7 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
KDM2AQ9Y2K7 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KDM2AQ9Y2K7 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
KDM2AQ9Y2K7 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
KDM2AQ9Y2K7 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
KDM2AQ9Y2K7 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
KDM2AQ9Y2K7 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
KDM2AQ9Y2K7 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KDM2AQ9Y2K7 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KDM2AQ9Y2K7 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
KDM2AQ9Y2K7 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KDM2AQ9Y2K7 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KDM2AQ9Y2K7 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KDM2AQ9Y2K7 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KDM2AQ9Y2K7 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.56
KDM2AQ9Y2K7 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KDM2AQ9Y2K7 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
KDM2AQ9Y2K7 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KDM2AQ9Y2K7 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KDM2AQ9Y2K7 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KDM2AQ9Y2K7 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KDM2AQ9Y2K7 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KDM2AQ9Y2K7 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
KDM2AQ9Y2K7 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
KDM2AQ9Y2K7 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KDM2AQ9Y2K7 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KDM2AQ9Y2K7 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KDM2AQ9Y2K7 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KDM2AQ9Y2K7 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KDM2AQ9Y2K7 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KDM2AQ9Y2K7 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
KDM2AQ9Y2K7 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
KDM2AQ9Y2K7 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
KDM2AQ9Y2K7 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
KDM2AQ9Y2K7 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
KDM2AQ9Y2K7 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
KDM2AQ9Y2K7 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
KDM2AQ9Y2K7 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KDM2AQ9Y2K7 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
KDM2AQ9Y2K7 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
KDM2AQ9Y2K7 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
KDM2AQ9Y2K7 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KDM2AQ9Y2K7 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KDM2AQ9Y2K7 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KDM2AQ9Y2K7 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KDM2AQ9Y2K7 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
KDM2AQ9Y2K7 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KDM2AQ9Y2K7 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
KDM2AQ9Y2K7 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KDM2AQ9Y2K7 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KDM2AQ9Y2K7 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KDM2AQ9Y2K7 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
KDM2AQ9Y2K7 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
KDM2AQ9Y2K7 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
KDM2AQ9Y2K7 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
KDM2AQ9Y2K7 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KDM2AQ9Y2K7 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KDM2AQ9Y2K7 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KDM2AQ9Y2K7 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KDM2AQ9Y2K7 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KDM2AQ9Y2K7 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KDM2AQ9Y2K7 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
KDM2AQ9Y2K7 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KDM2AQ9Y2K7 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
KDM2AQ9Y2K7 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
KDM2AQ9Y2K7 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KDM2AQ9Y2K7 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KDM2AQ9Y2K7 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KDM2AQ9Y2K7 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KDM2AQ9Y2K7 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
KDM2AQ9Y2K7 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
KDM2AQ9Y2K7 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KDM2AQ9Y2K7 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
KDM2AQ9Y2K7 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
KDM2AQ9Y2K7 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
KDM2AQ9Y2K7 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
KDM2AQ9Y2K7 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KDM2AQ9Y2K7 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
KDM2AQ9Y2K7 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KDM2AQ9Y2K7 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KDM2AQ9Y2K7 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KDM2AQ9Y2K7 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KDM2AQ9Y2K7 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KDM2AQ9Y2K7 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KDM2AQ9Y2K7 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KDM2AQ9Y2K7 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KDM2AQ9Y2K7 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KDM2AQ9Y2K7 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KDM2AQ9Y2K7 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KDM2AQ9Y2K7 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KDM2AQ9Y2K7 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
KDM2AQ9Y2K7 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KDM2AQ9Y2K7 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KDM2AQ9Y2K7 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KDM2AQ9Y2K7 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KDM2AQ9Y2K7 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KDM2AQ9Y2K7 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KDM2AQ9Y2K7 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KDM2AQ9Y2K7 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms