Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNL2

SSR3, Translocon-associated protein subunit gamma, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSR3Q9UNL2 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSR3Q9UNL2 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSR3Q9UNL2 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSR3Q9UNL2 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSR3Q9UNL2 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSR3Q9UNL2 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSR3Q9UNL2 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSR3Q9UNL2 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSR3Q9UNL2 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSR3Q9UNL2 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSR3Q9UNL2 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSR3Q9UNL2 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSR3Q9UNL2 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSR3Q9UNL2 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSR3Q9UNL2 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSR3Q9UNL2 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSR3Q9UNL2 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSR3Q9UNL2 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSR3Q9UNL2 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSR3Q9UNL2 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSR3Q9UNL2 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SSR3Q9UNL2 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSR3Q9UNL2 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSR3Q9UNL2 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSR3Q9UNL2 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSR3Q9UNL2 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSR3Q9UNL2 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSR3Q9UNL2 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSR3Q9UNL2 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSR3Q9UNL2 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSR3Q9UNL2 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSR3Q9UNL2 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSR3Q9UNL2 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSR3Q9UNL2 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSR3Q9UNL2 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSR3Q9UNL2 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSR3Q9UNL2 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSR3Q9UNL2 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSR3Q9UNL2 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSR3Q9UNL2 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSR3Q9UNL2 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SSR3Q9UNL2 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSR3Q9UNL2 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSR3Q9UNL2 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSR3Q9UNL2 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSR3Q9UNL2 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSR3Q9UNL2 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSR3Q9UNL2 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSR3Q9UNL2 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSR3Q9UNL2 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSR3Q9UNL2 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSR3Q9UNL2 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSR3Q9UNL2 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSR3Q9UNL2 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSR3Q9UNL2 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSR3Q9UNL2 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSR3Q9UNL2 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSR3Q9UNL2 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSR3Q9UNL2 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSR3Q9UNL2 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SSR3Q9UNL2 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSR3Q9UNL2 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSR3Q9UNL2 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSR3Q9UNL2 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSR3Q9UNL2 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSR3Q9UNL2 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSR3Q9UNL2 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSR3Q9UNL2 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSR3Q9UNL2 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSR3Q9UNL2 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSR3Q9UNL2 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSR3Q9UNL2 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSR3Q9UNL2 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSR3Q9UNL2 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSR3Q9UNL2 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSR3Q9UNL2 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSR3Q9UNL2 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSR3Q9UNL2 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSR3Q9UNL2 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSR3Q9UNL2 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSR3Q9UNL2 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSR3Q9UNL2 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSR3Q9UNL2 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSR3Q9UNL2 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSR3Q9UNL2 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSR3Q9UNL2 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSR3Q9UNL2 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSR3Q9UNL2 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSR3Q9UNL2 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSR3Q9UNL2 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSR3Q9UNL2 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSR3Q9UNL2 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSR3Q9UNL2 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SSR3Q9UNL2 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSR3Q9UNL2 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSR3Q9UNL2 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSR3Q9UNL2 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSR3Q9UNL2 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSR3Q9UNL2 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSR3Q9UNL2 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms