Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJV3

MID2, Probable E3 ubiquitin-protein ligase MID2, humanhuman

Predictions only

Length 735 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MID2Q9UJV3 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MID2Q9UJV3 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MID2Q9UJV3 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MID2Q9UJV3 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MID2Q9UJV3 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MID2Q9UJV3 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MID2Q9UJV3 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MID2Q9UJV3 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MID2Q9UJV3 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MID2Q9UJV3 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MID2Q9UJV3 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MID2Q9UJV3 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MID2Q9UJV3 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MID2Q9UJV3 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MID2Q9UJV3 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
MID2Q9UJV3 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MID2Q9UJV3 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MID2Q9UJV3 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MID2Q9UJV3 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MID2Q9UJV3 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MID2Q9UJV3 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MID2Q9UJV3 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MID2Q9UJV3 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MID2Q9UJV3 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MID2Q9UJV3 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MID2Q9UJV3 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
MID2Q9UJV3 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
MID2Q9UJV3 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
MID2Q9UJV3 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
MID2Q9UJV3 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MID2Q9UJV3 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MID2Q9UJV3 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MID2Q9UJV3 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MID2Q9UJV3 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MID2Q9UJV3 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MID2Q9UJV3 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MID2Q9UJV3 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MID2Q9UJV3 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MID2Q9UJV3 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MID2Q9UJV3 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MID2Q9UJV3 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MID2Q9UJV3 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MID2Q9UJV3 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MID2Q9UJV3 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MID2Q9UJV3 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MID2Q9UJV3 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MID2Q9UJV3 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MID2Q9UJV3 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
MID2Q9UJV3 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MID2Q9UJV3 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MID2Q9UJV3 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MID2Q9UJV3 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MID2Q9UJV3 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MID2Q9UJV3 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MID2Q9UJV3 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MID2Q9UJV3 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MID2Q9UJV3 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MID2Q9UJV3 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MID2Q9UJV3 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MID2Q9UJV3 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MID2Q9UJV3 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
MID2Q9UJV3 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MID2Q9UJV3 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MID2Q9UJV3 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MID2Q9UJV3 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MID2Q9UJV3 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MID2Q9UJV3 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MID2Q9UJV3 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MID2Q9UJV3 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MID2Q9UJV3 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MID2Q9UJV3 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MID2Q9UJV3 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MID2Q9UJV3 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MID2Q9UJV3 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MID2Q9UJV3 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MID2Q9UJV3 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MID2Q9UJV3 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MID2Q9UJV3 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MID2Q9UJV3 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MID2Q9UJV3 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
MID2Q9UJV3 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
MID2Q9UJV3 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
MID2Q9UJV3 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
MID2Q9UJV3 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
MID2Q9UJV3 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MID2Q9UJV3 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MID2Q9UJV3 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MID2Q9UJV3 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MID2Q9UJV3 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MID2Q9UJV3 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MID2Q9UJV3 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MID2Q9UJV3 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MID2Q9UJV3 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MID2Q9UJV3 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MID2Q9UJV3 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MID2Q9UJV3 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MID2Q9UJV3 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MID2Q9UJV3 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MID2Q9UJV3 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MID2Q9UJV3 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms