Protein–RNA interactions for Protein: Q9UD57

NKX1-2, NK1 transcription factor-related protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-2Q9UD57 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NKX1-2Q9UD57 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NKX1-2Q9UD57 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NKX1-2Q9UD57 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NKX1-2Q9UD57 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NKX1-2Q9UD57 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NKX1-2Q9UD57 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NKX1-2Q9UD57 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NKX1-2Q9UD57 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NKX1-2Q9UD57 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NKX1-2Q9UD57 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NKX1-2Q9UD57 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NKX1-2Q9UD57 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
NKX1-2Q9UD57 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NKX1-2Q9UD57 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NKX1-2Q9UD57 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NKX1-2Q9UD57 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NKX1-2Q9UD57 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NKX1-2Q9UD57 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NKX1-2Q9UD57 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NKX1-2Q9UD57 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NKX1-2Q9UD57 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NKX1-2Q9UD57 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NKX1-2Q9UD57 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NKX1-2Q9UD57 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NKX1-2Q9UD57 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NKX1-2Q9UD57 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NKX1-2Q9UD57 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NKX1-2Q9UD57 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NKX1-2Q9UD57 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NKX1-2Q9UD57 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NKX1-2Q9UD57 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NKX1-2Q9UD57 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NKX1-2Q9UD57 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NKX1-2Q9UD57 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NKX1-2Q9UD57 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NKX1-2Q9UD57 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NKX1-2Q9UD57 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NKX1-2Q9UD57 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NKX1-2Q9UD57 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NKX1-2Q9UD57 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NKX1-2Q9UD57 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NKX1-2Q9UD57 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NKX1-2Q9UD57 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NKX1-2Q9UD57 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NKX1-2Q9UD57 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NKX1-2Q9UD57 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
NKX1-2Q9UD57 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
NKX1-2Q9UD57 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NKX1-2Q9UD57 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NKX1-2Q9UD57 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NKX1-2Q9UD57 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NKX1-2Q9UD57 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NKX1-2Q9UD57 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
NKX1-2Q9UD57 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NKX1-2Q9UD57 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NKX1-2Q9UD57 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NKX1-2Q9UD57 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NKX1-2Q9UD57 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NKX1-2Q9UD57 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NKX1-2Q9UD57 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NKX1-2Q9UD57 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NKX1-2Q9UD57 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
NKX1-2Q9UD57 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
NKX1-2Q9UD57 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
NKX1-2Q9UD57 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
NKX1-2Q9UD57 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
NKX1-2Q9UD57 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.23
NKX1-2Q9UD57 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
NKX1-2Q9UD57 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
NKX1-2Q9UD57 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NKX1-2Q9UD57 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NKX1-2Q9UD57 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NKX1-2Q9UD57 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NKX1-2Q9UD57 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
NKX1-2Q9UD57 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NKX1-2Q9UD57 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NKX1-2Q9UD57 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NKX1-2Q9UD57 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NKX1-2Q9UD57 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NKX1-2Q9UD57 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NKX1-2Q9UD57 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
NKX1-2Q9UD57 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NKX1-2Q9UD57 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NKX1-2Q9UD57 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NKX1-2Q9UD57 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
NKX1-2Q9UD57 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NKX1-2Q9UD57 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NKX1-2Q9UD57 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NKX1-2Q9UD57 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NKX1-2Q9UD57 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NKX1-2Q9UD57 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NKX1-2Q9UD57 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NKX1-2Q9UD57 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NKX1-2Q9UD57 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NKX1-2Q9UD57 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NKX1-2Q9UD57 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NKX1-2Q9UD57 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NKX1-2Q9UD57 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
NKX1-2Q9UD57 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms