Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Y6

PHRF1, PHD and RING finger domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHRF1Q9P1Y6 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PHRF1Q9P1Y6 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PHRF1Q9P1Y6 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PHRF1Q9P1Y6 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PHRF1Q9P1Y6 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PHRF1Q9P1Y6 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PHRF1Q9P1Y6 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PHRF1Q9P1Y6 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PHRF1Q9P1Y6 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PHRF1Q9P1Y6 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PHRF1Q9P1Y6 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PHRF1Q9P1Y6 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PHRF1Q9P1Y6 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
PHRF1Q9P1Y6 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PHRF1Q9P1Y6 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PHRF1Q9P1Y6 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PHRF1Q9P1Y6 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PHRF1Q9P1Y6 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PHRF1Q9P1Y6 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PHRF1Q9P1Y6 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PHRF1Q9P1Y6 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PHRF1Q9P1Y6 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PHRF1Q9P1Y6 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PHRF1Q9P1Y6 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PHRF1Q9P1Y6 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PHRF1Q9P1Y6 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PHRF1Q9P1Y6 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PHRF1Q9P1Y6 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PHRF1Q9P1Y6 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PHRF1Q9P1Y6 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PHRF1Q9P1Y6 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PHRF1Q9P1Y6 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PHRF1Q9P1Y6 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PHRF1Q9P1Y6 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PHRF1Q9P1Y6 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PHRF1Q9P1Y6 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PHRF1Q9P1Y6 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PHRF1Q9P1Y6 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PHRF1Q9P1Y6 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PHRF1Q9P1Y6 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PHRF1Q9P1Y6 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PHRF1Q9P1Y6 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PHRF1Q9P1Y6 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PHRF1Q9P1Y6 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PHRF1Q9P1Y6 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PHRF1Q9P1Y6 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PHRF1Q9P1Y6 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PHRF1Q9P1Y6 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PHRF1Q9P1Y6 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PHRF1Q9P1Y6 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PHRF1Q9P1Y6 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PHRF1Q9P1Y6 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PHRF1Q9P1Y6 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PHRF1Q9P1Y6 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PHRF1Q9P1Y6 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PHRF1Q9P1Y6 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PHRF1Q9P1Y6 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PHRF1Q9P1Y6 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PHRF1Q9P1Y6 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PHRF1Q9P1Y6 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PHRF1Q9P1Y6 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PHRF1Q9P1Y6 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PHRF1Q9P1Y6 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PHRF1Q9P1Y6 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PHRF1Q9P1Y6 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PHRF1Q9P1Y6 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PHRF1Q9P1Y6 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PHRF1Q9P1Y6 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PHRF1Q9P1Y6 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PHRF1Q9P1Y6 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PHRF1Q9P1Y6 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PHRF1Q9P1Y6 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PHRF1Q9P1Y6 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PHRF1Q9P1Y6 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PHRF1Q9P1Y6 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PHRF1Q9P1Y6 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PHRF1Q9P1Y6 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PHRF1Q9P1Y6 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PHRF1Q9P1Y6 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PHRF1Q9P1Y6 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PHRF1Q9P1Y6 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PHRF1Q9P1Y6 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PHRF1Q9P1Y6 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PHRF1Q9P1Y6 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PHRF1Q9P1Y6 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PHRF1Q9P1Y6 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PHRF1Q9P1Y6 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PHRF1Q9P1Y6 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PHRF1Q9P1Y6 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PHRF1Q9P1Y6 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PHRF1Q9P1Y6 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PHRF1Q9P1Y6 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PHRF1Q9P1Y6 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PHRF1Q9P1Y6 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PHRF1Q9P1Y6 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PHRF1Q9P1Y6 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PHRF1Q9P1Y6 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PHRF1Q9P1Y6 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PHRF1Q9P1Y6 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PHRF1Q9P1Y6 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms