Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXG0

CNTLN, Centlein, humanhuman

Predictions only

Length 1,405 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTLNQ9NXG0 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC25.58■■□□□ 1.68
CNTLNQ9NXG0 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CNTLNQ9NXG0 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CNTLNQ9NXG0 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CNTLNQ9NXG0 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CNTLNQ9NXG0 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CNTLNQ9NXG0 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CNTLNQ9NXG0 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CNTLNQ9NXG0 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CNTLNQ9NXG0 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CNTLNQ9NXG0 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CNTLNQ9NXG0 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CNTLNQ9NXG0 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
CNTLNQ9NXG0 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CNTLNQ9NXG0 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CNTLNQ9NXG0 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CNTLNQ9NXG0 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CNTLNQ9NXG0 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CNTLNQ9NXG0 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CNTLNQ9NXG0 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CNTLNQ9NXG0 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CNTLNQ9NXG0 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CNTLNQ9NXG0 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CNTLNQ9NXG0 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CNTLNQ9NXG0 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CNTLNQ9NXG0 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CNTLNQ9NXG0 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
CNTLNQ9NXG0 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CNTLNQ9NXG0 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CNTLNQ9NXG0 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
CNTLNQ9NXG0 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CNTLNQ9NXG0 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CNTLNQ9NXG0 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CNTLNQ9NXG0 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CNTLNQ9NXG0 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CNTLNQ9NXG0 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
CNTLNQ9NXG0 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CNTLNQ9NXG0 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CNTLNQ9NXG0 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CNTLNQ9NXG0 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CNTLNQ9NXG0 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CNTLNQ9NXG0 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CNTLNQ9NXG0 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CNTLNQ9NXG0 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CNTLNQ9NXG0 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CNTLNQ9NXG0 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CNTLNQ9NXG0 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CNTLNQ9NXG0 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CNTLNQ9NXG0 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CNTLNQ9NXG0 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CNTLNQ9NXG0 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CNTLNQ9NXG0 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CNTLNQ9NXG0 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
CNTLNQ9NXG0 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CNTLNQ9NXG0 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CNTLNQ9NXG0 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CNTLNQ9NXG0 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CNTLNQ9NXG0 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CNTLNQ9NXG0 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CNTLNQ9NXG0 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
CNTLNQ9NXG0 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CNTLNQ9NXG0 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CNTLNQ9NXG0 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CNTLNQ9NXG0 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CNTLNQ9NXG0 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CNTLNQ9NXG0 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CNTLNQ9NXG0 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CNTLNQ9NXG0 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CNTLNQ9NXG0 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
CNTLNQ9NXG0 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CNTLNQ9NXG0 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CNTLNQ9NXG0 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CNTLNQ9NXG0 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CNTLNQ9NXG0 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
CNTLNQ9NXG0 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
CNTLNQ9NXG0 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
CNTLNQ9NXG0 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CNTLNQ9NXG0 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CNTLNQ9NXG0 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CNTLNQ9NXG0 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CNTLNQ9NXG0 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CNTLNQ9NXG0 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CNTLNQ9NXG0 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CNTLNQ9NXG0 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CNTLNQ9NXG0 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
CNTLNQ9NXG0 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CNTLNQ9NXG0 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CNTLNQ9NXG0 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CNTLNQ9NXG0 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CNTLNQ9NXG0 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CNTLNQ9NXG0 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CNTLNQ9NXG0 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CNTLNQ9NXG0 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CNTLNQ9NXG0 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CNTLNQ9NXG0 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CNTLNQ9NXG0 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CNTLNQ9NXG0 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CNTLNQ9NXG0 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CNTLNQ9NXG0 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CNTLNQ9NXG0 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms