Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX77

ERVK13-1, Endogenous retrovirus group K member 13-1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK13-1Q9NX77 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ERVK13-1Q9NX77 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ERVK13-1Q9NX77 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ERVK13-1Q9NX77 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ERVK13-1Q9NX77 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ERVK13-1Q9NX77 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ERVK13-1Q9NX77 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ERVK13-1Q9NX77 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ERVK13-1Q9NX77 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ERVK13-1Q9NX77 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ERVK13-1Q9NX77 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ERVK13-1Q9NX77 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ERVK13-1Q9NX77 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ERVK13-1Q9NX77 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ERVK13-1Q9NX77 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ERVK13-1Q9NX77 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ERVK13-1Q9NX77 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ERVK13-1Q9NX77 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ERVK13-1Q9NX77 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ERVK13-1Q9NX77 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ERVK13-1Q9NX77 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ERVK13-1Q9NX77 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
ERVK13-1Q9NX77 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ERVK13-1Q9NX77 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
ERVK13-1Q9NX77 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ERVK13-1Q9NX77 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ERVK13-1Q9NX77 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ERVK13-1Q9NX77 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ERVK13-1Q9NX77 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ERVK13-1Q9NX77 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
ERVK13-1Q9NX77 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ERVK13-1Q9NX77 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ERVK13-1Q9NX77 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ERVK13-1Q9NX77 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ERVK13-1Q9NX77 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ERVK13-1Q9NX77 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ERVK13-1Q9NX77 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ERVK13-1Q9NX77 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ERVK13-1Q9NX77 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ERVK13-1Q9NX77 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
ERVK13-1Q9NX77 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
ERVK13-1Q9NX77 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
ERVK13-1Q9NX77 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ERVK13-1Q9NX77 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ERVK13-1Q9NX77 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ERVK13-1Q9NX77 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ERVK13-1Q9NX77 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ERVK13-1Q9NX77 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ERVK13-1Q9NX77 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ERVK13-1Q9NX77 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ERVK13-1Q9NX77 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ERVK13-1Q9NX77 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ERVK13-1Q9NX77 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ERVK13-1Q9NX77 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ERVK13-1Q9NX77 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
ERVK13-1Q9NX77 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
ERVK13-1Q9NX77 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
ERVK13-1Q9NX77 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
ERVK13-1Q9NX77 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
ERVK13-1Q9NX77 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ERVK13-1Q9NX77 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ERVK13-1Q9NX77 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ERVK13-1Q9NX77 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ERVK13-1Q9NX77 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ERVK13-1Q9NX77 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ERVK13-1Q9NX77 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ERVK13-1Q9NX77 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ERVK13-1Q9NX77 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ERVK13-1Q9NX77 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ERVK13-1Q9NX77 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ERVK13-1Q9NX77 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ERVK13-1Q9NX77 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ERVK13-1Q9NX77 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ERVK13-1Q9NX77 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ERVK13-1Q9NX77 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ERVK13-1Q9NX77 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ERVK13-1Q9NX77 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
ERVK13-1Q9NX77 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ERVK13-1Q9NX77 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
ERVK13-1Q9NX77 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ERVK13-1Q9NX77 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ERVK13-1Q9NX77 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ERVK13-1Q9NX77 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ERVK13-1Q9NX77 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ERVK13-1Q9NX77 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ERVK13-1Q9NX77 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ERVK13-1Q9NX77 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ERVK13-1Q9NX77 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ERVK13-1Q9NX77 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ERVK13-1Q9NX77 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ERVK13-1Q9NX77 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ERVK13-1Q9NX77 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ERVK13-1Q9NX77 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ERVK13-1Q9NX77 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ERVK13-1Q9NX77 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ERVK13-1Q9NX77 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ERVK13-1Q9NX77 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ERVK13-1Q9NX77 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ERVK13-1Q9NX77 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ERVK13-1Q9NX77 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms