Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSB4

KRT82, Keratin, type II cuticular Hb2, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT82Q9NSB4 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KRT82Q9NSB4 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KRT82Q9NSB4 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KRT82Q9NSB4 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KRT82Q9NSB4 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KRT82Q9NSB4 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KRT82Q9NSB4 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KRT82Q9NSB4 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KRT82Q9NSB4 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KRT82Q9NSB4 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KRT82Q9NSB4 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KRT82Q9NSB4 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KRT82Q9NSB4 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KRT82Q9NSB4 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KRT82Q9NSB4 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KRT82Q9NSB4 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KRT82Q9NSB4 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KRT82Q9NSB4 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KRT82Q9NSB4 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KRT82Q9NSB4 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KRT82Q9NSB4 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KRT82Q9NSB4 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KRT82Q9NSB4 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KRT82Q9NSB4 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KRT82Q9NSB4 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
KRT82Q9NSB4 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KRT82Q9NSB4 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KRT82Q9NSB4 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KRT82Q9NSB4 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KRT82Q9NSB4 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
KRT82Q9NSB4 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KRT82Q9NSB4 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KRT82Q9NSB4 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KRT82Q9NSB4 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KRT82Q9NSB4 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KRT82Q9NSB4 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KRT82Q9NSB4 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KRT82Q9NSB4 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KRT82Q9NSB4 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KRT82Q9NSB4 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KRT82Q9NSB4 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
KRT82Q9NSB4 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KRT82Q9NSB4 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
KRT82Q9NSB4 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KRT82Q9NSB4 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
KRT82Q9NSB4 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KRT82Q9NSB4 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KRT82Q9NSB4 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KRT82Q9NSB4 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KRT82Q9NSB4 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KRT82Q9NSB4 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KRT82Q9NSB4 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KRT82Q9NSB4 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KRT82Q9NSB4 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
KRT82Q9NSB4 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
KRT82Q9NSB4 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KRT82Q9NSB4 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
KRT82Q9NSB4 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KRT82Q9NSB4 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KRT82Q9NSB4 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KRT82Q9NSB4 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
KRT82Q9NSB4 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KRT82Q9NSB4 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KRT82Q9NSB4 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KRT82Q9NSB4 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KRT82Q9NSB4 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KRT82Q9NSB4 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KRT82Q9NSB4 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KRT82Q9NSB4 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KRT82Q9NSB4 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KRT82Q9NSB4 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KRT82Q9NSB4 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KRT82Q9NSB4 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KRT82Q9NSB4 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KRT82Q9NSB4 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KRT82Q9NSB4 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KRT82Q9NSB4 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KRT82Q9NSB4 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KRT82Q9NSB4 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KRT82Q9NSB4 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KRT82Q9NSB4 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KRT82Q9NSB4 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KRT82Q9NSB4 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KRT82Q9NSB4 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KRT82Q9NSB4 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KRT82Q9NSB4 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KRT82Q9NSB4 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KRT82Q9NSB4 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KRT82Q9NSB4 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KRT82Q9NSB4 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KRT82Q9NSB4 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KRT82Q9NSB4 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KRT82Q9NSB4 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KRT82Q9NSB4 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KRT82Q9NSB4 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KRT82Q9NSB4 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KRT82Q9NSB4 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KRT82Q9NSB4 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
KRT82Q9NSB4 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KRT82Q9NSB4 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.5 ms