Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAB3

SLC52A2, Solute carrier family 52, riboflavin transporter, member 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC52A2Q9HAB3 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC52A2Q9HAB3 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC52A2Q9HAB3 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC52A2Q9HAB3 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC52A2Q9HAB3 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC52A2Q9HAB3 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC52A2Q9HAB3 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC52A2Q9HAB3 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC52A2Q9HAB3 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC52A2Q9HAB3 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC52A2Q9HAB3 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC52A2Q9HAB3 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC52A2Q9HAB3 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC52A2Q9HAB3 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC52A2Q9HAB3 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC52A2Q9HAB3 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC52A2Q9HAB3 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC52A2Q9HAB3 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC52A2Q9HAB3 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC52A2Q9HAB3 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC52A2Q9HAB3 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC52A2Q9HAB3 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC52A2Q9HAB3 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC52A2Q9HAB3 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC52A2Q9HAB3 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC52A2Q9HAB3 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC52A2Q9HAB3 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC52A2Q9HAB3 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC52A2Q9HAB3 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC52A2Q9HAB3 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC52A2Q9HAB3 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC52A2Q9HAB3 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC52A2Q9HAB3 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC52A2Q9HAB3 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC52A2Q9HAB3 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC52A2Q9HAB3 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC52A2Q9HAB3 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC52A2Q9HAB3 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC52A2Q9HAB3 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC52A2Q9HAB3 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC52A2Q9HAB3 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC52A2Q9HAB3 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC52A2Q9HAB3 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC52A2Q9HAB3 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC52A2Q9HAB3 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC52A2Q9HAB3 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC52A2Q9HAB3 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC52A2Q9HAB3 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC52A2Q9HAB3 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC52A2Q9HAB3 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC52A2Q9HAB3 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC52A2Q9HAB3 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC52A2Q9HAB3 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC52A2Q9HAB3 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC52A2Q9HAB3 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC52A2Q9HAB3 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC52A2Q9HAB3 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC52A2Q9HAB3 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC52A2Q9HAB3 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC52A2Q9HAB3 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC52A2Q9HAB3 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC52A2Q9HAB3 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC52A2Q9HAB3 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC52A2Q9HAB3 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC52A2Q9HAB3 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC52A2Q9HAB3 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC52A2Q9HAB3 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC52A2Q9HAB3 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC52A2Q9HAB3 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC52A2Q9HAB3 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC52A2Q9HAB3 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC52A2Q9HAB3 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC52A2Q9HAB3 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC52A2Q9HAB3 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC52A2Q9HAB3 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC52A2Q9HAB3 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC52A2Q9HAB3 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC52A2Q9HAB3 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC52A2Q9HAB3 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC52A2Q9HAB3 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC52A2Q9HAB3 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC52A2Q9HAB3 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC52A2Q9HAB3 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC52A2Q9HAB3 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC52A2Q9HAB3 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC52A2Q9HAB3 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC52A2Q9HAB3 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC52A2Q9HAB3 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC52A2Q9HAB3 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC52A2Q9HAB3 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC52A2Q9HAB3 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC52A2Q9HAB3 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC52A2Q9HAB3 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC52A2Q9HAB3 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC52A2Q9HAB3 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC52A2Q9HAB3 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC52A2Q9HAB3 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC52A2Q9HAB3 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC52A2Q9HAB3 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC52A2Q9HAB3 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms