Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C7

AMBRA1, Activating molecule in BECN1-regulated autophagy protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMBRA1Q9C0C7 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
AMBRA1Q9C0C7 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
AMBRA1Q9C0C7 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
AMBRA1Q9C0C7 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
AMBRA1Q9C0C7 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
AMBRA1Q9C0C7 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
AMBRA1Q9C0C7 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
AMBRA1Q9C0C7 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
AMBRA1Q9C0C7 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
AMBRA1Q9C0C7 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
AMBRA1Q9C0C7 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
AMBRA1Q9C0C7 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
AMBRA1Q9C0C7 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
AMBRA1Q9C0C7 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
AMBRA1Q9C0C7 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
AMBRA1Q9C0C7 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
AMBRA1Q9C0C7 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
AMBRA1Q9C0C7 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
AMBRA1Q9C0C7 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
AMBRA1Q9C0C7 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
AMBRA1Q9C0C7 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
AMBRA1Q9C0C7 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
AMBRA1Q9C0C7 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
AMBRA1Q9C0C7 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
AMBRA1Q9C0C7 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
AMBRA1Q9C0C7 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
AMBRA1Q9C0C7 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
AMBRA1Q9C0C7 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
AMBRA1Q9C0C7 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
AMBRA1Q9C0C7 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
AMBRA1Q9C0C7 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
AMBRA1Q9C0C7 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
AMBRA1Q9C0C7 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
AMBRA1Q9C0C7 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
AMBRA1Q9C0C7 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
AMBRA1Q9C0C7 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
AMBRA1Q9C0C7 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
AMBRA1Q9C0C7 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
AMBRA1Q9C0C7 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
AMBRA1Q9C0C7 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
AMBRA1Q9C0C7 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
AMBRA1Q9C0C7 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
AMBRA1Q9C0C7 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
AMBRA1Q9C0C7 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
AMBRA1Q9C0C7 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
AMBRA1Q9C0C7 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
AMBRA1Q9C0C7 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
AMBRA1Q9C0C7 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
AMBRA1Q9C0C7 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
AMBRA1Q9C0C7 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
AMBRA1Q9C0C7 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
AMBRA1Q9C0C7 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
AMBRA1Q9C0C7 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
AMBRA1Q9C0C7 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
AMBRA1Q9C0C7 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
AMBRA1Q9C0C7 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
AMBRA1Q9C0C7 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
AMBRA1Q9C0C7 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
AMBRA1Q9C0C7 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
AMBRA1Q9C0C7 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
AMBRA1Q9C0C7 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
AMBRA1Q9C0C7 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
AMBRA1Q9C0C7 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
AMBRA1Q9C0C7 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
AMBRA1Q9C0C7 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
AMBRA1Q9C0C7 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
AMBRA1Q9C0C7 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
AMBRA1Q9C0C7 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
AMBRA1Q9C0C7 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
AMBRA1Q9C0C7 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
AMBRA1Q9C0C7 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
AMBRA1Q9C0C7 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
AMBRA1Q9C0C7 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
AMBRA1Q9C0C7 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
AMBRA1Q9C0C7 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
AMBRA1Q9C0C7 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
AMBRA1Q9C0C7 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
AMBRA1Q9C0C7 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
AMBRA1Q9C0C7 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
AMBRA1Q9C0C7 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
AMBRA1Q9C0C7 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
AMBRA1Q9C0C7 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
AMBRA1Q9C0C7 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
AMBRA1Q9C0C7 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
AMBRA1Q9C0C7 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
AMBRA1Q9C0C7 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
AMBRA1Q9C0C7 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
AMBRA1Q9C0C7 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
AMBRA1Q9C0C7 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
AMBRA1Q9C0C7 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
AMBRA1Q9C0C7 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
AMBRA1Q9C0C7 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
AMBRA1Q9C0C7 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
AMBRA1Q9C0C7 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
AMBRA1Q9C0C7 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
AMBRA1Q9C0C7 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
AMBRA1Q9C0C7 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
AMBRA1Q9C0C7 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
AMBRA1Q9C0C7 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
AMBRA1Q9C0C7 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms