Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C4

SEMA4C, Semaphorin-4C, humanhuman

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4CQ9C0C4 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SEMA4CQ9C0C4 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SEMA4CQ9C0C4 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SEMA4CQ9C0C4 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SEMA4CQ9C0C4 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SEMA4CQ9C0C4 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SEMA4CQ9C0C4 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SEMA4CQ9C0C4 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SEMA4CQ9C0C4 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SEMA4CQ9C0C4 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SEMA4CQ9C0C4 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SEMA4CQ9C0C4 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SEMA4CQ9C0C4 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SEMA4CQ9C0C4 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SEMA4CQ9C0C4 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SEMA4CQ9C0C4 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SEMA4CQ9C0C4 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SEMA4CQ9C0C4 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SEMA4CQ9C0C4 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SEMA4CQ9C0C4 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SEMA4CQ9C0C4 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SEMA4CQ9C0C4 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SEMA4CQ9C0C4 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SEMA4CQ9C0C4 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SEMA4CQ9C0C4 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SEMA4CQ9C0C4 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SEMA4CQ9C0C4 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SEMA4CQ9C0C4 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SEMA4CQ9C0C4 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SEMA4CQ9C0C4 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SEMA4CQ9C0C4 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SEMA4CQ9C0C4 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SEMA4CQ9C0C4 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SEMA4CQ9C0C4 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SEMA4CQ9C0C4 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SEMA4CQ9C0C4 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SEMA4CQ9C0C4 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SEMA4CQ9C0C4 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SEMA4CQ9C0C4 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SEMA4CQ9C0C4 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SEMA4CQ9C0C4 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SEMA4CQ9C0C4 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SEMA4CQ9C0C4 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SEMA4CQ9C0C4 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SEMA4CQ9C0C4 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SEMA4CQ9C0C4 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SEMA4CQ9C0C4 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SEMA4CQ9C0C4 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SEMA4CQ9C0C4 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SEMA4CQ9C0C4 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SEMA4CQ9C0C4 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SEMA4CQ9C0C4 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SEMA4CQ9C0C4 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SEMA4CQ9C0C4 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SEMA4CQ9C0C4 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SEMA4CQ9C0C4 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SEMA4CQ9C0C4 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SEMA4CQ9C0C4 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SEMA4CQ9C0C4 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SEMA4CQ9C0C4 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SEMA4CQ9C0C4 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SEMA4CQ9C0C4 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SEMA4CQ9C0C4 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SEMA4CQ9C0C4 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SEMA4CQ9C0C4 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SEMA4CQ9C0C4 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SEMA4CQ9C0C4 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SEMA4CQ9C0C4 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SEMA4CQ9C0C4 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SEMA4CQ9C0C4 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SEMA4CQ9C0C4 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SEMA4CQ9C0C4 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SEMA4CQ9C0C4 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SEMA4CQ9C0C4 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SEMA4CQ9C0C4 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SEMA4CQ9C0C4 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SEMA4CQ9C0C4 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SEMA4CQ9C0C4 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SEMA4CQ9C0C4 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SEMA4CQ9C0C4 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SEMA4CQ9C0C4 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SEMA4CQ9C0C4 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SEMA4CQ9C0C4 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SEMA4CQ9C0C4 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SEMA4CQ9C0C4 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SEMA4CQ9C0C4 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SEMA4CQ9C0C4 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SEMA4CQ9C0C4 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SEMA4CQ9C0C4 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SEMA4CQ9C0C4 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SEMA4CQ9C0C4 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SEMA4CQ9C0C4 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SEMA4CQ9C0C4 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SEMA4CQ9C0C4 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SEMA4CQ9C0C4 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SEMA4CQ9C0C4 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SEMA4CQ9C0C4 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SEMA4CQ9C0C4 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SEMA4CQ9C0C4 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SEMA4CQ9C0C4 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms