Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZX4

ROPN1B, Ropporin-1B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROPN1BQ9BZX4 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ROPN1BQ9BZX4 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ROPN1BQ9BZX4 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ROPN1BQ9BZX4 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ROPN1BQ9BZX4 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ROPN1BQ9BZX4 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ROPN1BQ9BZX4 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ROPN1BQ9BZX4 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ROPN1BQ9BZX4 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ROPN1BQ9BZX4 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ROPN1BQ9BZX4 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ROPN1BQ9BZX4 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ROPN1BQ9BZX4 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ROPN1BQ9BZX4 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
ROPN1BQ9BZX4 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ROPN1BQ9BZX4 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ROPN1BQ9BZX4 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ROPN1BQ9BZX4 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ROPN1BQ9BZX4 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ROPN1BQ9BZX4 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ROPN1BQ9BZX4 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
ROPN1BQ9BZX4 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ROPN1BQ9BZX4 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ROPN1BQ9BZX4 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ROPN1BQ9BZX4 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ROPN1BQ9BZX4 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ROPN1BQ9BZX4 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ROPN1BQ9BZX4 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ROPN1BQ9BZX4 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ROPN1BQ9BZX4 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ROPN1BQ9BZX4 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ROPN1BQ9BZX4 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ROPN1BQ9BZX4 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ROPN1BQ9BZX4 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ROPN1BQ9BZX4 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ROPN1BQ9BZX4 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ROPN1BQ9BZX4 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ROPN1BQ9BZX4 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ROPN1BQ9BZX4 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ROPN1BQ9BZX4 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ROPN1BQ9BZX4 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ROPN1BQ9BZX4 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ROPN1BQ9BZX4 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ROPN1BQ9BZX4 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ROPN1BQ9BZX4 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ROPN1BQ9BZX4 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ROPN1BQ9BZX4 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ROPN1BQ9BZX4 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ROPN1BQ9BZX4 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ROPN1BQ9BZX4 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ROPN1BQ9BZX4 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
ROPN1BQ9BZX4 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ROPN1BQ9BZX4 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ROPN1BQ9BZX4 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ROPN1BQ9BZX4 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
ROPN1BQ9BZX4 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
ROPN1BQ9BZX4 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ROPN1BQ9BZX4 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ROPN1BQ9BZX4 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ROPN1BQ9BZX4 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ROPN1BQ9BZX4 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ROPN1BQ9BZX4 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
ROPN1BQ9BZX4 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ROPN1BQ9BZX4 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ROPN1BQ9BZX4 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
ROPN1BQ9BZX4 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ROPN1BQ9BZX4 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ROPN1BQ9BZX4 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ROPN1BQ9BZX4 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ROPN1BQ9BZX4 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ROPN1BQ9BZX4 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ROPN1BQ9BZX4 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ROPN1BQ9BZX4 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ROPN1BQ9BZX4 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ROPN1BQ9BZX4 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ROPN1BQ9BZX4 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ROPN1BQ9BZX4 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ROPN1BQ9BZX4 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ROPN1BQ9BZX4 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ROPN1BQ9BZX4 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ROPN1BQ9BZX4 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ROPN1BQ9BZX4 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ROPN1BQ9BZX4 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ROPN1BQ9BZX4 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ROPN1BQ9BZX4 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ROPN1BQ9BZX4 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ROPN1BQ9BZX4 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ROPN1BQ9BZX4 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ROPN1BQ9BZX4 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ROPN1BQ9BZX4 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ROPN1BQ9BZX4 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ROPN1BQ9BZX4 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ROPN1BQ9BZX4 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ROPN1BQ9BZX4 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
ROPN1BQ9BZX4 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ROPN1BQ9BZX4 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ROPN1BQ9BZX4 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ROPN1BQ9BZX4 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ROPN1BQ9BZX4 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ROPN1BQ9BZX4 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms