Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZ95

NSD3, Histone-lysine N-methyltransferase NSD3, humanhuman

Predictions only

Length 1,437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSD3Q9BZ95 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NSD3Q9BZ95 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NSD3Q9BZ95 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NSD3Q9BZ95 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
NSD3Q9BZ95 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NSD3Q9BZ95 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NSD3Q9BZ95 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NSD3Q9BZ95 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NSD3Q9BZ95 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NSD3Q9BZ95 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NSD3Q9BZ95 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NSD3Q9BZ95 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
NSD3Q9BZ95 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NSD3Q9BZ95 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NSD3Q9BZ95 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NSD3Q9BZ95 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NSD3Q9BZ95 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NSD3Q9BZ95 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NSD3Q9BZ95 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NSD3Q9BZ95 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NSD3Q9BZ95 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NSD3Q9BZ95 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NSD3Q9BZ95 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NSD3Q9BZ95 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NSD3Q9BZ95 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NSD3Q9BZ95 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NSD3Q9BZ95 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NSD3Q9BZ95 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NSD3Q9BZ95 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NSD3Q9BZ95 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NSD3Q9BZ95 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NSD3Q9BZ95 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NSD3Q9BZ95 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NSD3Q9BZ95 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NSD3Q9BZ95 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
NSD3Q9BZ95 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NSD3Q9BZ95 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NSD3Q9BZ95 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
NSD3Q9BZ95 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
NSD3Q9BZ95 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NSD3Q9BZ95 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NSD3Q9BZ95 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
NSD3Q9BZ95 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NSD3Q9BZ95 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NSD3Q9BZ95 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NSD3Q9BZ95 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
NSD3Q9BZ95 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NSD3Q9BZ95 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
NSD3Q9BZ95 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
NSD3Q9BZ95 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NSD3Q9BZ95 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NSD3Q9BZ95 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NSD3Q9BZ95 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NSD3Q9BZ95 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NSD3Q9BZ95 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NSD3Q9BZ95 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NSD3Q9BZ95 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NSD3Q9BZ95 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NSD3Q9BZ95 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NSD3Q9BZ95 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NSD3Q9BZ95 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NSD3Q9BZ95 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NSD3Q9BZ95 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NSD3Q9BZ95 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NSD3Q9BZ95 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NSD3Q9BZ95 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NSD3Q9BZ95 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
NSD3Q9BZ95 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NSD3Q9BZ95 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NSD3Q9BZ95 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NSD3Q9BZ95 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
NSD3Q9BZ95 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NSD3Q9BZ95 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
NSD3Q9BZ95 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
NSD3Q9BZ95 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
NSD3Q9BZ95 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NSD3Q9BZ95 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NSD3Q9BZ95 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
NSD3Q9BZ95 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NSD3Q9BZ95 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NSD3Q9BZ95 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NSD3Q9BZ95 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NSD3Q9BZ95 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NSD3Q9BZ95 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NSD3Q9BZ95 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NSD3Q9BZ95 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NSD3Q9BZ95 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NSD3Q9BZ95 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NSD3Q9BZ95 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NSD3Q9BZ95 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NSD3Q9BZ95 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NSD3Q9BZ95 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NSD3Q9BZ95 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NSD3Q9BZ95 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NSD3Q9BZ95 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NSD3Q9BZ95 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NSD3Q9BZ95 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NSD3Q9BZ95 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NSD3Q9BZ95 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NSD3Q9BZ95 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms