Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV6

TRIM55, Tripartite motif-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM55Q9BYV6 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRIM55Q9BYV6 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRIM55Q9BYV6 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRIM55Q9BYV6 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRIM55Q9BYV6 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRIM55Q9BYV6 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRIM55Q9BYV6 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRIM55Q9BYV6 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRIM55Q9BYV6 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRIM55Q9BYV6 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRIM55Q9BYV6 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRIM55Q9BYV6 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRIM55Q9BYV6 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRIM55Q9BYV6 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRIM55Q9BYV6 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIM55Q9BYV6 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIM55Q9BYV6 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIM55Q9BYV6 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIM55Q9BYV6 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIM55Q9BYV6 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIM55Q9BYV6 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIM55Q9BYV6 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIM55Q9BYV6 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIM55Q9BYV6 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIM55Q9BYV6 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIM55Q9BYV6 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIM55Q9BYV6 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIM55Q9BYV6 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIM55Q9BYV6 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIM55Q9BYV6 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIM55Q9BYV6 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIM55Q9BYV6 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIM55Q9BYV6 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIM55Q9BYV6 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIM55Q9BYV6 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIM55Q9BYV6 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIM55Q9BYV6 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIM55Q9BYV6 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIM55Q9BYV6 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIM55Q9BYV6 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIM55Q9BYV6 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIM55Q9BYV6 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIM55Q9BYV6 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIM55Q9BYV6 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIM55Q9BYV6 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIM55Q9BYV6 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIM55Q9BYV6 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIM55Q9BYV6 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIM55Q9BYV6 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIM55Q9BYV6 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIM55Q9BYV6 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIM55Q9BYV6 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIM55Q9BYV6 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIM55Q9BYV6 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIM55Q9BYV6 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIM55Q9BYV6 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIM55Q9BYV6 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIM55Q9BYV6 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIM55Q9BYV6 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIM55Q9BYV6 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIM55Q9BYV6 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIM55Q9BYV6 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIM55Q9BYV6 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIM55Q9BYV6 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.41
TRIM55Q9BYV6 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TRIM55Q9BYV6 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
TRIM55Q9BYV6 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
TRIM55Q9BYV6 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TRIM55Q9BYV6 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
TRIM55Q9BYV6 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TRIM55Q9BYV6 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TRIM55Q9BYV6 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TRIM55Q9BYV6 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TRIM55Q9BYV6 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TRIM55Q9BYV6 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TRIM55Q9BYV6 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
TRIM55Q9BYV6 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRIM55Q9BYV6 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRIM55Q9BYV6 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRIM55Q9BYV6 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRIM55Q9BYV6 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRIM55Q9BYV6 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRIM55Q9BYV6 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRIM55Q9BYV6 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRIM55Q9BYV6 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRIM55Q9BYV6 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRIM55Q9BYV6 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRIM55Q9BYV6 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRIM55Q9BYV6 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRIM55Q9BYV6 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
TRIM55Q9BYV6 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRIM55Q9BYV6 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRIM55Q9BYV6 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRIM55Q9BYV6 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRIM55Q9BYV6 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRIM55Q9BYV6 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRIM55Q9BYV6 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRIM55Q9BYV6 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRIM55Q9BYV6 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRIM55Q9BYV6 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms