Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYE7

PCGF6, Polycomb group RING finger protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF6Q9BYE7 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PCGF6Q9BYE7 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PCGF6Q9BYE7 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PCGF6Q9BYE7 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PCGF6Q9BYE7 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PCGF6Q9BYE7 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PCGF6Q9BYE7 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PCGF6Q9BYE7 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PCGF6Q9BYE7 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PCGF6Q9BYE7 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PCGF6Q9BYE7 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PCGF6Q9BYE7 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PCGF6Q9BYE7 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
PCGF6Q9BYE7 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PCGF6Q9BYE7 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PCGF6Q9BYE7 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PCGF6Q9BYE7 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PCGF6Q9BYE7 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PCGF6Q9BYE7 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PCGF6Q9BYE7 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PCGF6Q9BYE7 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PCGF6Q9BYE7 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PCGF6Q9BYE7 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PCGF6Q9BYE7 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PCGF6Q9BYE7 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PCGF6Q9BYE7 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PCGF6Q9BYE7 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
PCGF6Q9BYE7 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
PCGF6Q9BYE7 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PCGF6Q9BYE7 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PCGF6Q9BYE7 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PCGF6Q9BYE7 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PCGF6Q9BYE7 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PCGF6Q9BYE7 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PCGF6Q9BYE7 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PCGF6Q9BYE7 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PCGF6Q9BYE7 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PCGF6Q9BYE7 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PCGF6Q9BYE7 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PCGF6Q9BYE7 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PCGF6Q9BYE7 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PCGF6Q9BYE7 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PCGF6Q9BYE7 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PCGF6Q9BYE7 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PCGF6Q9BYE7 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PCGF6Q9BYE7 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PCGF6Q9BYE7 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PCGF6Q9BYE7 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PCGF6Q9BYE7 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PCGF6Q9BYE7 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PCGF6Q9BYE7 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PCGF6Q9BYE7 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PCGF6Q9BYE7 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PCGF6Q9BYE7 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PCGF6Q9BYE7 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PCGF6Q9BYE7 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PCGF6Q9BYE7 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PCGF6Q9BYE7 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PCGF6Q9BYE7 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PCGF6Q9BYE7 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PCGF6Q9BYE7 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PCGF6Q9BYE7 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PCGF6Q9BYE7 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PCGF6Q9BYE7 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PCGF6Q9BYE7 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PCGF6Q9BYE7 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PCGF6Q9BYE7 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PCGF6Q9BYE7 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PCGF6Q9BYE7 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PCGF6Q9BYE7 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PCGF6Q9BYE7 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
PCGF6Q9BYE7 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PCGF6Q9BYE7 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PCGF6Q9BYE7 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PCGF6Q9BYE7 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
PCGF6Q9BYE7 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PCGF6Q9BYE7 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PCGF6Q9BYE7 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PCGF6Q9BYE7 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
PCGF6Q9BYE7 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PCGF6Q9BYE7 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PCGF6Q9BYE7 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PCGF6Q9BYE7 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PCGF6Q9BYE7 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PCGF6Q9BYE7 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PCGF6Q9BYE7 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PCGF6Q9BYE7 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PCGF6Q9BYE7 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PCGF6Q9BYE7 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PCGF6Q9BYE7 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PCGF6Q9BYE7 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PCGF6Q9BYE7 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PCGF6Q9BYE7 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PCGF6Q9BYE7 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PCGF6Q9BYE7 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PCGF6Q9BYE7 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PCGF6Q9BYE7 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PCGF6Q9BYE7 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PCGF6Q9BYE7 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PCGF6Q9BYE7 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms