Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWE0

REPIN1, Replication initiator 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REPIN1Q9BWE0 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
REPIN1Q9BWE0 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
REPIN1Q9BWE0 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
REPIN1Q9BWE0 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
REPIN1Q9BWE0 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
REPIN1Q9BWE0 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
REPIN1Q9BWE0 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
REPIN1Q9BWE0 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
REPIN1Q9BWE0 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
REPIN1Q9BWE0 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
REPIN1Q9BWE0 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
REPIN1Q9BWE0 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
REPIN1Q9BWE0 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
REPIN1Q9BWE0 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
REPIN1Q9BWE0 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
REPIN1Q9BWE0 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
REPIN1Q9BWE0 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
REPIN1Q9BWE0 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
REPIN1Q9BWE0 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
REPIN1Q9BWE0 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
REPIN1Q9BWE0 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
REPIN1Q9BWE0 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
REPIN1Q9BWE0 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
REPIN1Q9BWE0 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
REPIN1Q9BWE0 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
REPIN1Q9BWE0 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
REPIN1Q9BWE0 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
REPIN1Q9BWE0 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
REPIN1Q9BWE0 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
REPIN1Q9BWE0 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
REPIN1Q9BWE0 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
REPIN1Q9BWE0 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
REPIN1Q9BWE0 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
REPIN1Q9BWE0 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
REPIN1Q9BWE0 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
REPIN1Q9BWE0 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
REPIN1Q9BWE0 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
REPIN1Q9BWE0 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
REPIN1Q9BWE0 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
REPIN1Q9BWE0 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
REPIN1Q9BWE0 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
REPIN1Q9BWE0 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
REPIN1Q9BWE0 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
REPIN1Q9BWE0 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
REPIN1Q9BWE0 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
REPIN1Q9BWE0 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
REPIN1Q9BWE0 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
REPIN1Q9BWE0 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
REPIN1Q9BWE0 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
REPIN1Q9BWE0 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
REPIN1Q9BWE0 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
REPIN1Q9BWE0 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
REPIN1Q9BWE0 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
REPIN1Q9BWE0 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
REPIN1Q9BWE0 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
REPIN1Q9BWE0 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
REPIN1Q9BWE0 AC087289.4-201ENST00000587348 230 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
REPIN1Q9BWE0 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
REPIN1Q9BWE0 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
REPIN1Q9BWE0 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
REPIN1Q9BWE0 AL031430.1-201ENST00000642067 1039 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
REPIN1Q9BWE0 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
REPIN1Q9BWE0 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
REPIN1Q9BWE0 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
REPIN1Q9BWE0 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
REPIN1Q9BWE0 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
REPIN1Q9BWE0 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
REPIN1Q9BWE0 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
REPIN1Q9BWE0 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
REPIN1Q9BWE0 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
REPIN1Q9BWE0 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
REPIN1Q9BWE0 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
REPIN1Q9BWE0 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
REPIN1Q9BWE0 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
REPIN1Q9BWE0 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
REPIN1Q9BWE0 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
REPIN1Q9BWE0 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
REPIN1Q9BWE0 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
REPIN1Q9BWE0 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
REPIN1Q9BWE0 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
REPIN1Q9BWE0 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
REPIN1Q9BWE0 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
REPIN1Q9BWE0 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
REPIN1Q9BWE0 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
REPIN1Q9BWE0 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
REPIN1Q9BWE0 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
REPIN1Q9BWE0 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
REPIN1Q9BWE0 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
REPIN1Q9BWE0 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
REPIN1Q9BWE0 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
REPIN1Q9BWE0 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
REPIN1Q9BWE0 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
REPIN1Q9BWE0 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
REPIN1Q9BWE0 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
REPIN1Q9BWE0 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
REPIN1Q9BWE0 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
REPIN1Q9BWE0 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
REPIN1Q9BWE0 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
REPIN1Q9BWE0 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
REPIN1Q9BWE0 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.2 ms