Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVV2

FNDC11, Fibronectin type III domain-containing protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC11Q9BVV2 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FNDC11Q9BVV2 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FNDC11Q9BVV2 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FNDC11Q9BVV2 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FNDC11Q9BVV2 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
FNDC11Q9BVV2 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FNDC11Q9BVV2 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FNDC11Q9BVV2 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FNDC11Q9BVV2 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FNDC11Q9BVV2 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FNDC11Q9BVV2 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FNDC11Q9BVV2 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FNDC11Q9BVV2 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FNDC11Q9BVV2 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FNDC11Q9BVV2 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FNDC11Q9BVV2 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FNDC11Q9BVV2 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FNDC11Q9BVV2 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FNDC11Q9BVV2 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FNDC11Q9BVV2 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
FNDC11Q9BVV2 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
FNDC11Q9BVV2 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
FNDC11Q9BVV2 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
FNDC11Q9BVV2 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
FNDC11Q9BVV2 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
FNDC11Q9BVV2 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FNDC11Q9BVV2 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FNDC11Q9BVV2 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FNDC11Q9BVV2 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FNDC11Q9BVV2 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FNDC11Q9BVV2 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FNDC11Q9BVV2 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FNDC11Q9BVV2 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FNDC11Q9BVV2 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FNDC11Q9BVV2 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FNDC11Q9BVV2 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
FNDC11Q9BVV2 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
FNDC11Q9BVV2 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FNDC11Q9BVV2 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FNDC11Q9BVV2 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FNDC11Q9BVV2 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FNDC11Q9BVV2 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FNDC11Q9BVV2 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
FNDC11Q9BVV2 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
FNDC11Q9BVV2 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FNDC11Q9BVV2 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FNDC11Q9BVV2 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
FNDC11Q9BVV2 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FNDC11Q9BVV2 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FNDC11Q9BVV2 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FNDC11Q9BVV2 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FNDC11Q9BVV2 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FNDC11Q9BVV2 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FNDC11Q9BVV2 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FNDC11Q9BVV2 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FNDC11Q9BVV2 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FNDC11Q9BVV2 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FNDC11Q9BVV2 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FNDC11Q9BVV2 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FNDC11Q9BVV2 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FNDC11Q9BVV2 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
FNDC11Q9BVV2 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FNDC11Q9BVV2 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FNDC11Q9BVV2 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FNDC11Q9BVV2 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FNDC11Q9BVV2 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FNDC11Q9BVV2 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FNDC11Q9BVV2 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FNDC11Q9BVV2 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FNDC11Q9BVV2 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FNDC11Q9BVV2 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FNDC11Q9BVV2 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FNDC11Q9BVV2 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FNDC11Q9BVV2 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FNDC11Q9BVV2 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FNDC11Q9BVV2 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FNDC11Q9BVV2 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
FNDC11Q9BVV2 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FNDC11Q9BVV2 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FNDC11Q9BVV2 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
FNDC11Q9BVV2 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FNDC11Q9BVV2 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FNDC11Q9BVV2 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FNDC11Q9BVV2 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FNDC11Q9BVV2 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FNDC11Q9BVV2 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FNDC11Q9BVV2 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FNDC11Q9BVV2 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FNDC11Q9BVV2 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FNDC11Q9BVV2 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FNDC11Q9BVV2 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FNDC11Q9BVV2 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FNDC11Q9BVV2 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FNDC11Q9BVV2 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FNDC11Q9BVV2 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FNDC11Q9BVV2 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
FNDC11Q9BVV2 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FNDC11Q9BVV2 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FNDC11Q9BVV2 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FNDC11Q9BVV2 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms