Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUZ4

TRAF4, TNF receptor-associated factor 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF4Q9BUZ4 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAF4Q9BUZ4 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAF4Q9BUZ4 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAF4Q9BUZ4 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAF4Q9BUZ4 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAF4Q9BUZ4 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAF4Q9BUZ4 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAF4Q9BUZ4 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAF4Q9BUZ4 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAF4Q9BUZ4 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAF4Q9BUZ4 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAF4Q9BUZ4 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAF4Q9BUZ4 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAF4Q9BUZ4 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAF4Q9BUZ4 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAF4Q9BUZ4 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAF4Q9BUZ4 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAF4Q9BUZ4 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAF4Q9BUZ4 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAF4Q9BUZ4 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAF4Q9BUZ4 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAF4Q9BUZ4 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAF4Q9BUZ4 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAF4Q9BUZ4 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAF4Q9BUZ4 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAF4Q9BUZ4 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAF4Q9BUZ4 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAF4Q9BUZ4 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAF4Q9BUZ4 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAF4Q9BUZ4 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAF4Q9BUZ4 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAF4Q9BUZ4 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAF4Q9BUZ4 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAF4Q9BUZ4 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAF4Q9BUZ4 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAF4Q9BUZ4 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAF4Q9BUZ4 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAF4Q9BUZ4 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TRAF4Q9BUZ4 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TRAF4Q9BUZ4 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
TRAF4Q9BUZ4 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
TRAF4Q9BUZ4 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TRAF4Q9BUZ4 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TRAF4Q9BUZ4 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TRAF4Q9BUZ4 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TRAF4Q9BUZ4 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TRAF4Q9BUZ4 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRAF4Q9BUZ4 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRAF4Q9BUZ4 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRAF4Q9BUZ4 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRAF4Q9BUZ4 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRAF4Q9BUZ4 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRAF4Q9BUZ4 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRAF4Q9BUZ4 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRAF4Q9BUZ4 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRAF4Q9BUZ4 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRAF4Q9BUZ4 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRAF4Q9BUZ4 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRAF4Q9BUZ4 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRAF4Q9BUZ4 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRAF4Q9BUZ4 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRAF4Q9BUZ4 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRAF4Q9BUZ4 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRAF4Q9BUZ4 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TRAF4Q9BUZ4 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRAF4Q9BUZ4 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TRAF4Q9BUZ4 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRAF4Q9BUZ4 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRAF4Q9BUZ4 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TRAF4Q9BUZ4 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRAF4Q9BUZ4 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRAF4Q9BUZ4 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRAF4Q9BUZ4 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRAF4Q9BUZ4 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRAF4Q9BUZ4 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRAF4Q9BUZ4 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRAF4Q9BUZ4 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRAF4Q9BUZ4 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRAF4Q9BUZ4 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRAF4Q9BUZ4 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRAF4Q9BUZ4 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRAF4Q9BUZ4 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRAF4Q9BUZ4 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRAF4Q9BUZ4 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRAF4Q9BUZ4 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRAF4Q9BUZ4 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRAF4Q9BUZ4 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRAF4Q9BUZ4 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRAF4Q9BUZ4 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRAF4Q9BUZ4 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRAF4Q9BUZ4 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRAF4Q9BUZ4 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRAF4Q9BUZ4 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRAF4Q9BUZ4 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRAF4Q9BUZ4 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TRAF4Q9BUZ4 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRAF4Q9BUZ4 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRAF4Q9BUZ4 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRAF4Q9BUZ4 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRAF4Q9BUZ4 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms