Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUP0

EFHD1, EF-hand domain-containing protein D1, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFHD1Q9BUP0 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
EFHD1Q9BUP0 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EFHD1Q9BUP0 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
EFHD1Q9BUP0 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EFHD1Q9BUP0 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EFHD1Q9BUP0 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EFHD1Q9BUP0 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EFHD1Q9BUP0 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EFHD1Q9BUP0 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EFHD1Q9BUP0 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EFHD1Q9BUP0 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EFHD1Q9BUP0 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EFHD1Q9BUP0 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
EFHD1Q9BUP0 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EFHD1Q9BUP0 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EFHD1Q9BUP0 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EFHD1Q9BUP0 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
EFHD1Q9BUP0 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
EFHD1Q9BUP0 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EFHD1Q9BUP0 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EFHD1Q9BUP0 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
EFHD1Q9BUP0 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
EFHD1Q9BUP0 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
EFHD1Q9BUP0 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EFHD1Q9BUP0 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EFHD1Q9BUP0 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
EFHD1Q9BUP0 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EFHD1Q9BUP0 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
EFHD1Q9BUP0 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EFHD1Q9BUP0 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
EFHD1Q9BUP0 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
EFHD1Q9BUP0 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
EFHD1Q9BUP0 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
EFHD1Q9BUP0 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
EFHD1Q9BUP0 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EFHD1Q9BUP0 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
EFHD1Q9BUP0 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
EFHD1Q9BUP0 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EFHD1Q9BUP0 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
EFHD1Q9BUP0 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EFHD1Q9BUP0 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EFHD1Q9BUP0 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EFHD1Q9BUP0 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EFHD1Q9BUP0 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
EFHD1Q9BUP0 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EFHD1Q9BUP0 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
EFHD1Q9BUP0 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EFHD1Q9BUP0 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EFHD1Q9BUP0 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
EFHD1Q9BUP0 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EFHD1Q9BUP0 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EFHD1Q9BUP0 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
EFHD1Q9BUP0 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
EFHD1Q9BUP0 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
EFHD1Q9BUP0 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
EFHD1Q9BUP0 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
EFHD1Q9BUP0 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
EFHD1Q9BUP0 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
EFHD1Q9BUP0 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
EFHD1Q9BUP0 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
EFHD1Q9BUP0 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
EFHD1Q9BUP0 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
EFHD1Q9BUP0 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
EFHD1Q9BUP0 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
EFHD1Q9BUP0 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
EFHD1Q9BUP0 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
EFHD1Q9BUP0 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
EFHD1Q9BUP0 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
EFHD1Q9BUP0 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
EFHD1Q9BUP0 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
EFHD1Q9BUP0 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
EFHD1Q9BUP0 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
EFHD1Q9BUP0 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
EFHD1Q9BUP0 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
EFHD1Q9BUP0 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
EFHD1Q9BUP0 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
EFHD1Q9BUP0 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
EFHD1Q9BUP0 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
EFHD1Q9BUP0 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
EFHD1Q9BUP0 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
EFHD1Q9BUP0 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
EFHD1Q9BUP0 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
EFHD1Q9BUP0 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
EFHD1Q9BUP0 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
EFHD1Q9BUP0 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
EFHD1Q9BUP0 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
EFHD1Q9BUP0 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
EFHD1Q9BUP0 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
EFHD1Q9BUP0 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
EFHD1Q9BUP0 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
EFHD1Q9BUP0 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
EFHD1Q9BUP0 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
EFHD1Q9BUP0 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
EFHD1Q9BUP0 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
EFHD1Q9BUP0 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
EFHD1Q9BUP0 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
EFHD1Q9BUP0 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
EFHD1Q9BUP0 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
EFHD1Q9BUP0 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
EFHD1Q9BUP0 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms