Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUI4

POLR3C, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3CQ9BUI4 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
POLR3CQ9BUI4 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
POLR3CQ9BUI4 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
POLR3CQ9BUI4 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
POLR3CQ9BUI4 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
POLR3CQ9BUI4 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
POLR3CQ9BUI4 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
POLR3CQ9BUI4 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
POLR3CQ9BUI4 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
POLR3CQ9BUI4 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
POLR3CQ9BUI4 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
POLR3CQ9BUI4 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
POLR3CQ9BUI4 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
POLR3CQ9BUI4 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
POLR3CQ9BUI4 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
POLR3CQ9BUI4 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
POLR3CQ9BUI4 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
POLR3CQ9BUI4 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
POLR3CQ9BUI4 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
POLR3CQ9BUI4 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
POLR3CQ9BUI4 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
POLR3CQ9BUI4 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
POLR3CQ9BUI4 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
POLR3CQ9BUI4 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
POLR3CQ9BUI4 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
POLR3CQ9BUI4 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
POLR3CQ9BUI4 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
POLR3CQ9BUI4 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC19.33■□□□□ 0.68
POLR3CQ9BUI4 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
POLR3CQ9BUI4 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
POLR3CQ9BUI4 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
POLR3CQ9BUI4 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
POLR3CQ9BUI4 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
POLR3CQ9BUI4 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
POLR3CQ9BUI4 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
POLR3CQ9BUI4 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
POLR3CQ9BUI4 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
POLR3CQ9BUI4 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
POLR3CQ9BUI4 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
POLR3CQ9BUI4 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
POLR3CQ9BUI4 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
POLR3CQ9BUI4 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
POLR3CQ9BUI4 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
POLR3CQ9BUI4 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
POLR3CQ9BUI4 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
POLR3CQ9BUI4 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
POLR3CQ9BUI4 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
POLR3CQ9BUI4 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
POLR3CQ9BUI4 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
POLR3CQ9BUI4 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
POLR3CQ9BUI4 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
POLR3CQ9BUI4 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
POLR3CQ9BUI4 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
POLR3CQ9BUI4 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
POLR3CQ9BUI4 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
POLR3CQ9BUI4 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
POLR3CQ9BUI4 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
POLR3CQ9BUI4 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
POLR3CQ9BUI4 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
POLR3CQ9BUI4 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
POLR3CQ9BUI4 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
POLR3CQ9BUI4 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
POLR3CQ9BUI4 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
POLR3CQ9BUI4 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
POLR3CQ9BUI4 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
POLR3CQ9BUI4 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
POLR3CQ9BUI4 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
POLR3CQ9BUI4 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
POLR3CQ9BUI4 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
POLR3CQ9BUI4 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
POLR3CQ9BUI4 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
POLR3CQ9BUI4 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
POLR3CQ9BUI4 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
POLR3CQ9BUI4 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
POLR3CQ9BUI4 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
POLR3CQ9BUI4 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
POLR3CQ9BUI4 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
POLR3CQ9BUI4 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
POLR3CQ9BUI4 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
POLR3CQ9BUI4 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
POLR3CQ9BUI4 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
POLR3CQ9BUI4 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
POLR3CQ9BUI4 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
POLR3CQ9BUI4 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
POLR3CQ9BUI4 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
POLR3CQ9BUI4 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
POLR3CQ9BUI4 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
POLR3CQ9BUI4 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
POLR3CQ9BUI4 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
POLR3CQ9BUI4 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
POLR3CQ9BUI4 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
POLR3CQ9BUI4 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
POLR3CQ9BUI4 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
POLR3CQ9BUI4 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
POLR3CQ9BUI4 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
POLR3CQ9BUI4 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
POLR3CQ9BUI4 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
POLR3CQ9BUI4 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
POLR3CQ9BUI4 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
POLR3CQ9BUI4 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms