Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTF0

THUMPD2, THUMP domain-containing protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THUMPD2Q9BTF0 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
THUMPD2Q9BTF0 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
THUMPD2Q9BTF0 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
THUMPD2Q9BTF0 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
THUMPD2Q9BTF0 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
THUMPD2Q9BTF0 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
THUMPD2Q9BTF0 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
THUMPD2Q9BTF0 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
THUMPD2Q9BTF0 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
THUMPD2Q9BTF0 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
THUMPD2Q9BTF0 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
THUMPD2Q9BTF0 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
THUMPD2Q9BTF0 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
THUMPD2Q9BTF0 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
THUMPD2Q9BTF0 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
THUMPD2Q9BTF0 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
THUMPD2Q9BTF0 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
THUMPD2Q9BTF0 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
THUMPD2Q9BTF0 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
THUMPD2Q9BTF0 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
THUMPD2Q9BTF0 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
THUMPD2Q9BTF0 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
THUMPD2Q9BTF0 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
THUMPD2Q9BTF0 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
THUMPD2Q9BTF0 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
THUMPD2Q9BTF0 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
THUMPD2Q9BTF0 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
THUMPD2Q9BTF0 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
THUMPD2Q9BTF0 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
THUMPD2Q9BTF0 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
THUMPD2Q9BTF0 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
THUMPD2Q9BTF0 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
THUMPD2Q9BTF0 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
THUMPD2Q9BTF0 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
THUMPD2Q9BTF0 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
THUMPD2Q9BTF0 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
THUMPD2Q9BTF0 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
THUMPD2Q9BTF0 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
THUMPD2Q9BTF0 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
THUMPD2Q9BTF0 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
THUMPD2Q9BTF0 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
THUMPD2Q9BTF0 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
THUMPD2Q9BTF0 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
THUMPD2Q9BTF0 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
THUMPD2Q9BTF0 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
THUMPD2Q9BTF0 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
THUMPD2Q9BTF0 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
THUMPD2Q9BTF0 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
THUMPD2Q9BTF0 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
THUMPD2Q9BTF0 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
THUMPD2Q9BTF0 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
THUMPD2Q9BTF0 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
THUMPD2Q9BTF0 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
THUMPD2Q9BTF0 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
THUMPD2Q9BTF0 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
THUMPD2Q9BTF0 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
THUMPD2Q9BTF0 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
THUMPD2Q9BTF0 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
THUMPD2Q9BTF0 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
THUMPD2Q9BTF0 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
THUMPD2Q9BTF0 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
THUMPD2Q9BTF0 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
THUMPD2Q9BTF0 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
THUMPD2Q9BTF0 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
THUMPD2Q9BTF0 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
THUMPD2Q9BTF0 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
THUMPD2Q9BTF0 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
THUMPD2Q9BTF0 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
THUMPD2Q9BTF0 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
THUMPD2Q9BTF0 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
THUMPD2Q9BTF0 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
THUMPD2Q9BTF0 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
THUMPD2Q9BTF0 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
THUMPD2Q9BTF0 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
THUMPD2Q9BTF0 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
THUMPD2Q9BTF0 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
THUMPD2Q9BTF0 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
THUMPD2Q9BTF0 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
THUMPD2Q9BTF0 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
THUMPD2Q9BTF0 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
THUMPD2Q9BTF0 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
THUMPD2Q9BTF0 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
THUMPD2Q9BTF0 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
THUMPD2Q9BTF0 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
THUMPD2Q9BTF0 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
THUMPD2Q9BTF0 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
THUMPD2Q9BTF0 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
THUMPD2Q9BTF0 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
THUMPD2Q9BTF0 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
THUMPD2Q9BTF0 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
THUMPD2Q9BTF0 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
THUMPD2Q9BTF0 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
THUMPD2Q9BTF0 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
THUMPD2Q9BTF0 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
THUMPD2Q9BTF0 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
THUMPD2Q9BTF0 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
THUMPD2Q9BTF0 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
THUMPD2Q9BTF0 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
THUMPD2Q9BTF0 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
THUMPD2Q9BTF0 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms