Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTE3

MCMBP, Mini-chromosome maintenance complex-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCMBPQ9BTE3 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
MCMBPQ9BTE3 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MCMBPQ9BTE3 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MCMBPQ9BTE3 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MCMBPQ9BTE3 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MCMBPQ9BTE3 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MCMBPQ9BTE3 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
MCMBPQ9BTE3 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
MCMBPQ9BTE3 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MCMBPQ9BTE3 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MCMBPQ9BTE3 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
MCMBPQ9BTE3 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
MCMBPQ9BTE3 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
MCMBPQ9BTE3 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
MCMBPQ9BTE3 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MCMBPQ9BTE3 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
MCMBPQ9BTE3 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
MCMBPQ9BTE3 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MCMBPQ9BTE3 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MCMBPQ9BTE3 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
MCMBPQ9BTE3 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
MCMBPQ9BTE3 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
MCMBPQ9BTE3 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
MCMBPQ9BTE3 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
MCMBPQ9BTE3 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
MCMBPQ9BTE3 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
MCMBPQ9BTE3 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
MCMBPQ9BTE3 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
MCMBPQ9BTE3 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MCMBPQ9BTE3 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MCMBPQ9BTE3 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
MCMBPQ9BTE3 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MCMBPQ9BTE3 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
MCMBPQ9BTE3 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MCMBPQ9BTE3 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MCMBPQ9BTE3 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
MCMBPQ9BTE3 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
MCMBPQ9BTE3 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MCMBPQ9BTE3 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MCMBPQ9BTE3 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
MCMBPQ9BTE3 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
MCMBPQ9BTE3 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MCMBPQ9BTE3 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
MCMBPQ9BTE3 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
MCMBPQ9BTE3 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
MCMBPQ9BTE3 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
MCMBPQ9BTE3 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
MCMBPQ9BTE3 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
MCMBPQ9BTE3 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
MCMBPQ9BTE3 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
MCMBPQ9BTE3 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
MCMBPQ9BTE3 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
MCMBPQ9BTE3 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
MCMBPQ9BTE3 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
MCMBPQ9BTE3 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
MCMBPQ9BTE3 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
MCMBPQ9BTE3 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
MCMBPQ9BTE3 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
MCMBPQ9BTE3 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
MCMBPQ9BTE3 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
MCMBPQ9BTE3 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
MCMBPQ9BTE3 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
MCMBPQ9BTE3 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
MCMBPQ9BTE3 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
MCMBPQ9BTE3 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
MCMBPQ9BTE3 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
MCMBPQ9BTE3 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
MCMBPQ9BTE3 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
MCMBPQ9BTE3 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
MCMBPQ9BTE3 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
MCMBPQ9BTE3 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
MCMBPQ9BTE3 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
MCMBPQ9BTE3 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
MCMBPQ9BTE3 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
MCMBPQ9BTE3 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
MCMBPQ9BTE3 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
MCMBPQ9BTE3 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
MCMBPQ9BTE3 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
MCMBPQ9BTE3 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
MCMBPQ9BTE3 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
MCMBPQ9BTE3 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
MCMBPQ9BTE3 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
MCMBPQ9BTE3 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
MCMBPQ9BTE3 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
MCMBPQ9BTE3 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
MCMBPQ9BTE3 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
MCMBPQ9BTE3 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
MCMBPQ9BTE3 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
MCMBPQ9BTE3 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
MCMBPQ9BTE3 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
MCMBPQ9BTE3 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
MCMBPQ9BTE3 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
MCMBPQ9BTE3 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
MCMBPQ9BTE3 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
MCMBPQ9BTE3 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
MCMBPQ9BTE3 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
MCMBPQ9BTE3 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
MCMBPQ9BTE3 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
MCMBPQ9BTE3 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
MCMBPQ9BTE3 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms